Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC122Q5T0U0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC122Q5T0U0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC122Q5T0U0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC122Q5T0U0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC122Q5T0U0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC122Q5T0U0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC122Q5T0U0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC122Q5T0U0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC122Q5T0U0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC122Q5T0U0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC122Q5T0U0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC122Q5T0U0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC122Q5T0U0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC122Q5T0U0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC122Q5T0U0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC122Q5T0U0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC122Q5T0U0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC122Q5T0U0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC122Q5T0U0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC122Q5T0U0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC122Q5T0U0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC122Q5T0U0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC122Q5T0U0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC122Q5T0U0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC122Q5T0U0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC122Q5T0U0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC122Q5T0U0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC122Q5T0U0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC122Q5T0U0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC122Q5T0U0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC122Q5T0U0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC122Q5T0U0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC122Q5T0U0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC122Q5T0U0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC122Q5T0U0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC122Q5T0U0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC122Q5T0U0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC122Q5T0U0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC122Q5T0U0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC122Q5T0U0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC122Q5T0U0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC122Q5T0U0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC122Q5T0U0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC122Q5T0U0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC122Q5T0U0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC122Q5T0U0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC122Q5T0U0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC122Q5T0U0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC122Q5T0U0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC122Q5T0U0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC122Q5T0U0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC122Q5T0U0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC122Q5T0U0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC122Q5T0U0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC122Q5T0U0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC122Q5T0U0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC122Q5T0U0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC122Q5T0U0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC122Q5T0U0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC122Q5T0U0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC122Q5T0U0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC122Q5T0U0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC122Q5T0U0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC122Q5T0U0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC122Q5T0U0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC122Q5T0U0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC122Q5T0U0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC122Q5T0U0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC122Q5T0U0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC122Q5T0U0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC122Q5T0U0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC122Q5T0U0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC122Q5T0U0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC122Q5T0U0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC122Q5T0U0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC122Q5T0U0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC122Q5T0U0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC122Q5T0U0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC122Q5T0U0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC122Q5T0U0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC122Q5T0U0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC122Q5T0U0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC122Q5T0U0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC122Q5T0U0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC122Q5T0U0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC122Q5T0U0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC122Q5T0U0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC122Q5T0U0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC122Q5T0U0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC122Q5T0U0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC122Q5T0U0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC122Q5T0U0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC122Q5T0U0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC122Q5T0U0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC122Q5T0U0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC122Q5T0U0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC122Q5T0U0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC122Q5T0U0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC122Q5T0U0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms