Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL7

PRAMEF14, PRAME family member 14, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF14Q5SWL7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRAMEF14Q5SWL7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRAMEF14Q5SWL7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRAMEF14Q5SWL7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRAMEF14Q5SWL7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRAMEF14Q5SWL7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRAMEF14Q5SWL7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRAMEF14Q5SWL7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRAMEF14Q5SWL7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRAMEF14Q5SWL7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF14Q5SWL7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRAMEF14Q5SWL7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRAMEF14Q5SWL7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRAMEF14Q5SWL7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRAMEF14Q5SWL7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRAMEF14Q5SWL7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRAMEF14Q5SWL7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRAMEF14Q5SWL7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PRAMEF14Q5SWL7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRAMEF14Q5SWL7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEF14Q5SWL7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEF14Q5SWL7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEF14Q5SWL7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEF14Q5SWL7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRAMEF14Q5SWL7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRAMEF14Q5SWL7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRAMEF14Q5SWL7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRAMEF14Q5SWL7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRAMEF14Q5SWL7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRAMEF14Q5SWL7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRAMEF14Q5SWL7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRAMEF14Q5SWL7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRAMEF14Q5SWL7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRAMEF14Q5SWL7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRAMEF14Q5SWL7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRAMEF14Q5SWL7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRAMEF14Q5SWL7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRAMEF14Q5SWL7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRAMEF14Q5SWL7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRAMEF14Q5SWL7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRAMEF14Q5SWL7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEF14Q5SWL7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEF14Q5SWL7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEF14Q5SWL7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRAMEF14Q5SWL7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRAMEF14Q5SWL7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRAMEF14Q5SWL7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRAMEF14Q5SWL7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRAMEF14Q5SWL7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRAMEF14Q5SWL7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRAMEF14Q5SWL7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRAMEF14Q5SWL7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRAMEF14Q5SWL7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEF14Q5SWL7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEF14Q5SWL7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEF14Q5SWL7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRAMEF14Q5SWL7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRAMEF14Q5SWL7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRAMEF14Q5SWL7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRAMEF14Q5SWL7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRAMEF14Q5SWL7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PRAMEF14Q5SWL7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRAMEF14Q5SWL7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRAMEF14Q5SWL7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRAMEF14Q5SWL7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRAMEF14Q5SWL7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRAMEF14Q5SWL7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRAMEF14Q5SWL7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRAMEF14Q5SWL7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRAMEF14Q5SWL7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRAMEF14Q5SWL7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRAMEF14Q5SWL7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRAMEF14Q5SWL7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRAMEF14Q5SWL7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRAMEF14Q5SWL7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRAMEF14Q5SWL7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRAMEF14Q5SWL7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRAMEF14Q5SWL7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF14Q5SWL7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF14Q5SWL7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF14Q5SWL7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF14Q5SWL7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF14Q5SWL7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF14Q5SWL7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF14Q5SWL7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRAMEF14Q5SWL7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEF14Q5SWL7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEF14Q5SWL7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF14Q5SWL7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF14Q5SWL7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF14Q5SWL7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF14Q5SWL7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF14Q5SWL7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF14Q5SWL7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF14Q5SWL7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF14Q5SWL7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF14Q5SWL7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF14Q5SWL7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms