Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ70

SPDYA, Speedy protein A, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYAQ5MJ70 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPDYAQ5MJ70 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPDYAQ5MJ70 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPDYAQ5MJ70 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPDYAQ5MJ70 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPDYAQ5MJ70 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPDYAQ5MJ70 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPDYAQ5MJ70 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPDYAQ5MJ70 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPDYAQ5MJ70 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPDYAQ5MJ70 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPDYAQ5MJ70 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SPDYAQ5MJ70 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPDYAQ5MJ70 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPDYAQ5MJ70 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPDYAQ5MJ70 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SPDYAQ5MJ70 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPDYAQ5MJ70 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPDYAQ5MJ70 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPDYAQ5MJ70 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPDYAQ5MJ70 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPDYAQ5MJ70 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPDYAQ5MJ70 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPDYAQ5MJ70 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPDYAQ5MJ70 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPDYAQ5MJ70 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPDYAQ5MJ70 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPDYAQ5MJ70 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPDYAQ5MJ70 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPDYAQ5MJ70 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPDYAQ5MJ70 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPDYAQ5MJ70 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPDYAQ5MJ70 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPDYAQ5MJ70 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPDYAQ5MJ70 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPDYAQ5MJ70 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPDYAQ5MJ70 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPDYAQ5MJ70 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPDYAQ5MJ70 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPDYAQ5MJ70 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPDYAQ5MJ70 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPDYAQ5MJ70 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPDYAQ5MJ70 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPDYAQ5MJ70 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPDYAQ5MJ70 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPDYAQ5MJ70 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPDYAQ5MJ70 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPDYAQ5MJ70 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPDYAQ5MJ70 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPDYAQ5MJ70 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPDYAQ5MJ70 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPDYAQ5MJ70 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPDYAQ5MJ70 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPDYAQ5MJ70 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPDYAQ5MJ70 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPDYAQ5MJ70 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPDYAQ5MJ70 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPDYAQ5MJ70 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPDYAQ5MJ70 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPDYAQ5MJ70 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPDYAQ5MJ70 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPDYAQ5MJ70 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPDYAQ5MJ70 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPDYAQ5MJ70 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPDYAQ5MJ70 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPDYAQ5MJ70 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPDYAQ5MJ70 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPDYAQ5MJ70 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPDYAQ5MJ70 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPDYAQ5MJ70 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPDYAQ5MJ70 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPDYAQ5MJ70 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPDYAQ5MJ70 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPDYAQ5MJ70 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPDYAQ5MJ70 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPDYAQ5MJ70 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPDYAQ5MJ70 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPDYAQ5MJ70 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPDYAQ5MJ70 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPDYAQ5MJ70 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPDYAQ5MJ70 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPDYAQ5MJ70 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SPDYAQ5MJ70 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPDYAQ5MJ70 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPDYAQ5MJ70 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPDYAQ5MJ70 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPDYAQ5MJ70 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPDYAQ5MJ70 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPDYAQ5MJ70 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPDYAQ5MJ70 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPDYAQ5MJ70 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPDYAQ5MJ70 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPDYAQ5MJ70 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPDYAQ5MJ70 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPDYAQ5MJ70 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPDYAQ5MJ70 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SPDYAQ5MJ70 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPDYAQ5MJ70 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPDYAQ5MJ70 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SPDYAQ5MJ70 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms