Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB41Q5JT25 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB41Q5JT25 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAB41Q5JT25 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAB41Q5JT25 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAB41Q5JT25 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB41Q5JT25 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB41Q5JT25 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB41Q5JT25 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB41Q5JT25 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB41Q5JT25 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB41Q5JT25 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB41Q5JT25 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB41Q5JT25 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB41Q5JT25 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB41Q5JT25 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB41Q5JT25 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB41Q5JT25 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB41Q5JT25 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB41Q5JT25 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB41Q5JT25 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB41Q5JT25 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB41Q5JT25 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB41Q5JT25 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB41Q5JT25 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB41Q5JT25 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB41Q5JT25 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB41Q5JT25 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB41Q5JT25 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB41Q5JT25 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB41Q5JT25 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB41Q5JT25 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RAB41Q5JT25 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB41Q5JT25 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB41Q5JT25 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB41Q5JT25 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB41Q5JT25 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB41Q5JT25 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB41Q5JT25 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RAB41Q5JT25 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RAB41Q5JT25 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAB41Q5JT25 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB41Q5JT25 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB41Q5JT25 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB41Q5JT25 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB41Q5JT25 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB41Q5JT25 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB41Q5JT25 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB41Q5JT25 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB41Q5JT25 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB41Q5JT25 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB41Q5JT25 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB41Q5JT25 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB41Q5JT25 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB41Q5JT25 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAB41Q5JT25 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RAB41Q5JT25 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB41Q5JT25 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB41Q5JT25 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB41Q5JT25 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB41Q5JT25 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB41Q5JT25 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB41Q5JT25 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB41Q5JT25 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB41Q5JT25 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB41Q5JT25 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB41Q5JT25 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB41Q5JT25 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB41Q5JT25 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB41Q5JT25 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB41Q5JT25 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB41Q5JT25 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB41Q5JT25 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB41Q5JT25 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB41Q5JT25 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB41Q5JT25 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB41Q5JT25 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB41Q5JT25 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB41Q5JT25 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB41Q5JT25 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB41Q5JT25 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB41Q5JT25 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB41Q5JT25 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB41Q5JT25 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB41Q5JT25 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB41Q5JT25 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB41Q5JT25 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB41Q5JT25 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB41Q5JT25 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB41Q5JT25 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB41Q5JT25 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB41Q5JT25 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB41Q5JT25 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB41Q5JT25 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB41Q5JT25 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB41Q5JT25 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB41Q5JT25 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB41Q5JT25 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB41Q5JT25 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB41Q5JT25 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms