Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
WDR44Q5JSH3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
WDR44Q5JSH3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
WDR44Q5JSH3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
WDR44Q5JSH3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
WDR44Q5JSH3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
WDR44Q5JSH3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
WDR44Q5JSH3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
WDR44Q5JSH3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
WDR44Q5JSH3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
WDR44Q5JSH3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
WDR44Q5JSH3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
WDR44Q5JSH3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
WDR44Q5JSH3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
WDR44Q5JSH3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
WDR44Q5JSH3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
WDR44Q5JSH3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
WDR44Q5JSH3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
WDR44Q5JSH3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
WDR44Q5JSH3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
WDR44Q5JSH3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
WDR44Q5JSH3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
WDR44Q5JSH3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
WDR44Q5JSH3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
WDR44Q5JSH3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
WDR44Q5JSH3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
WDR44Q5JSH3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
WDR44Q5JSH3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
WDR44Q5JSH3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
WDR44Q5JSH3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
WDR44Q5JSH3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
WDR44Q5JSH3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
WDR44Q5JSH3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
WDR44Q5JSH3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
WDR44Q5JSH3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
WDR44Q5JSH3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
WDR44Q5JSH3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
WDR44Q5JSH3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
WDR44Q5JSH3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
WDR44Q5JSH3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
WDR44Q5JSH3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
WDR44Q5JSH3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
WDR44Q5JSH3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
WDR44Q5JSH3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
WDR44Q5JSH3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
WDR44Q5JSH3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
WDR44Q5JSH3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
WDR44Q5JSH3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
WDR44Q5JSH3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
WDR44Q5JSH3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
WDR44Q5JSH3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
WDR44Q5JSH3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
WDR44Q5JSH3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
WDR44Q5JSH3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
WDR44Q5JSH3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
WDR44Q5JSH3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
WDR44Q5JSH3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
WDR44Q5JSH3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
WDR44Q5JSH3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
WDR44Q5JSH3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
WDR44Q5JSH3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
WDR44Q5JSH3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
WDR44Q5JSH3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
WDR44Q5JSH3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
WDR44Q5JSH3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
WDR44Q5JSH3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
WDR44Q5JSH3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
WDR44Q5JSH3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
WDR44Q5JSH3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
WDR44Q5JSH3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
WDR44Q5JSH3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
WDR44Q5JSH3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
WDR44Q5JSH3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
WDR44Q5JSH3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
WDR44Q5JSH3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
WDR44Q5JSH3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
WDR44Q5JSH3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
WDR44Q5JSH3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
WDR44Q5JSH3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
WDR44Q5JSH3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
WDR44Q5JSH3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
WDR44Q5JSH3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
WDR44Q5JSH3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
WDR44Q5JSH3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
WDR44Q5JSH3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
WDR44Q5JSH3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
WDR44Q5JSH3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
WDR44Q5JSH3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
WDR44Q5JSH3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
WDR44Q5JSH3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
WDR44Q5JSH3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
WDR44Q5JSH3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
WDR44Q5JSH3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
WDR44Q5JSH3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
WDR44Q5JSH3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
WDR44Q5JSH3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
WDR44Q5JSH3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
WDR44Q5JSH3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
WDR44Q5JSH3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
WDR44Q5JSH3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms