Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9K5

ZMAT1, Zinc finger matrin-type protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMAT1Q5H9K5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZMAT1Q5H9K5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZMAT1Q5H9K5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZMAT1Q5H9K5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZMAT1Q5H9K5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZMAT1Q5H9K5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMAT1Q5H9K5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZMAT1Q5H9K5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMAT1Q5H9K5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMAT1Q5H9K5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMAT1Q5H9K5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZMAT1Q5H9K5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMAT1Q5H9K5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMAT1Q5H9K5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZMAT1Q5H9K5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMAT1Q5H9K5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMAT1Q5H9K5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMAT1Q5H9K5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMAT1Q5H9K5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZMAT1Q5H9K5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZMAT1Q5H9K5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZMAT1Q5H9K5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZMAT1Q5H9K5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZMAT1Q5H9K5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZMAT1Q5H9K5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZMAT1Q5H9K5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZMAT1Q5H9K5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZMAT1Q5H9K5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZMAT1Q5H9K5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZMAT1Q5H9K5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZMAT1Q5H9K5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZMAT1Q5H9K5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZMAT1Q5H9K5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZMAT1Q5H9K5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZMAT1Q5H9K5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZMAT1Q5H9K5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZMAT1Q5H9K5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZMAT1Q5H9K5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZMAT1Q5H9K5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZMAT1Q5H9K5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZMAT1Q5H9K5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZMAT1Q5H9K5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZMAT1Q5H9K5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZMAT1Q5H9K5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZMAT1Q5H9K5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZMAT1Q5H9K5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZMAT1Q5H9K5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZMAT1Q5H9K5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZMAT1Q5H9K5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZMAT1Q5H9K5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZMAT1Q5H9K5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZMAT1Q5H9K5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZMAT1Q5H9K5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZMAT1Q5H9K5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZMAT1Q5H9K5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZMAT1Q5H9K5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZMAT1Q5H9K5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZMAT1Q5H9K5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZMAT1Q5H9K5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZMAT1Q5H9K5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZMAT1Q5H9K5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZMAT1Q5H9K5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZMAT1Q5H9K5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZMAT1Q5H9K5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZMAT1Q5H9K5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZMAT1Q5H9K5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZMAT1Q5H9K5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZMAT1Q5H9K5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZMAT1Q5H9K5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZMAT1Q5H9K5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZMAT1Q5H9K5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZMAT1Q5H9K5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZMAT1Q5H9K5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZMAT1Q5H9K5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZMAT1Q5H9K5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZMAT1Q5H9K5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZMAT1Q5H9K5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZMAT1Q5H9K5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZMAT1Q5H9K5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZMAT1Q5H9K5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZMAT1Q5H9K5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZMAT1Q5H9K5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZMAT1Q5H9K5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZMAT1Q5H9K5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZMAT1Q5H9K5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZMAT1Q5H9K5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZMAT1Q5H9K5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZMAT1Q5H9K5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZMAT1Q5H9K5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZMAT1Q5H9K5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZMAT1Q5H9K5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZMAT1Q5H9K5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZMAT1Q5H9K5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZMAT1Q5H9K5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZMAT1Q5H9K5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZMAT1Q5H9K5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZMAT1Q5H9K5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZMAT1Q5H9K5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZMAT1Q5H9K5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZMAT1Q5H9K5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms