Protein–RNA interactions for Protein: Q5GJ75

TNFAIP8L3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFAIP8L3Q5GJ75 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFAIP8L3Q5GJ75 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFAIP8L3Q5GJ75 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFAIP8L3Q5GJ75 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFAIP8L3Q5GJ75 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFAIP8L3Q5GJ75 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNFAIP8L3Q5GJ75 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNFAIP8L3Q5GJ75 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNFAIP8L3Q5GJ75 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFAIP8L3Q5GJ75 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFAIP8L3Q5GJ75 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFAIP8L3Q5GJ75 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFAIP8L3Q5GJ75 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFAIP8L3Q5GJ75 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFAIP8L3Q5GJ75 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFAIP8L3Q5GJ75 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFAIP8L3Q5GJ75 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFAIP8L3Q5GJ75 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFAIP8L3Q5GJ75 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFAIP8L3Q5GJ75 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFAIP8L3Q5GJ75 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNFAIP8L3Q5GJ75 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNFAIP8L3Q5GJ75 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFAIP8L3Q5GJ75 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFAIP8L3Q5GJ75 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFAIP8L3Q5GJ75 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFAIP8L3Q5GJ75 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFAIP8L3Q5GJ75 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFAIP8L3Q5GJ75 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFAIP8L3Q5GJ75 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFAIP8L3Q5GJ75 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNFAIP8L3Q5GJ75 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNFAIP8L3Q5GJ75 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFAIP8L3Q5GJ75 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFAIP8L3Q5GJ75 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNFAIP8L3Q5GJ75 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNFAIP8L3Q5GJ75 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNFAIP8L3Q5GJ75 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNFAIP8L3Q5GJ75 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFAIP8L3Q5GJ75 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFAIP8L3Q5GJ75 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNFAIP8L3Q5GJ75 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFAIP8L3Q5GJ75 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFAIP8L3Q5GJ75 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNFAIP8L3Q5GJ75 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNFAIP8L3Q5GJ75 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNFAIP8L3Q5GJ75 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNFAIP8L3Q5GJ75 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNFAIP8L3Q5GJ75 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TNFAIP8L3Q5GJ75 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFAIP8L3Q5GJ75 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNFAIP8L3Q5GJ75 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFAIP8L3Q5GJ75 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFAIP8L3Q5GJ75 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFAIP8L3Q5GJ75 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFAIP8L3Q5GJ75 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFAIP8L3Q5GJ75 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFAIP8L3Q5GJ75 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFAIP8L3Q5GJ75 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFAIP8L3Q5GJ75 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFAIP8L3Q5GJ75 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFAIP8L3Q5GJ75 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFAIP8L3Q5GJ75 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFAIP8L3Q5GJ75 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNFAIP8L3Q5GJ75 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFAIP8L3Q5GJ75 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFAIP8L3Q5GJ75 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFAIP8L3Q5GJ75 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFAIP8L3Q5GJ75 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFAIP8L3Q5GJ75 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFAIP8L3Q5GJ75 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFAIP8L3Q5GJ75 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFAIP8L3Q5GJ75 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFAIP8L3Q5GJ75 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFAIP8L3Q5GJ75 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFAIP8L3Q5GJ75 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFAIP8L3Q5GJ75 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFAIP8L3Q5GJ75 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFAIP8L3Q5GJ75 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFAIP8L3Q5GJ75 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFAIP8L3Q5GJ75 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFAIP8L3Q5GJ75 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFAIP8L3Q5GJ75 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP8L3Q5GJ75 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP8L3Q5GJ75 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms