Protein–RNA interactions for Protein: Q4W5N1

ABCA11P, Putative ATP-binding cassette sub-family A member 11, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA11PQ4W5N1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCA11PQ4W5N1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCA11PQ4W5N1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCA11PQ4W5N1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCA11PQ4W5N1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCA11PQ4W5N1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCA11PQ4W5N1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCA11PQ4W5N1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCA11PQ4W5N1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCA11PQ4W5N1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCA11PQ4W5N1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCA11PQ4W5N1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCA11PQ4W5N1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCA11PQ4W5N1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCA11PQ4W5N1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCA11PQ4W5N1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCA11PQ4W5N1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCA11PQ4W5N1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCA11PQ4W5N1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCA11PQ4W5N1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCA11PQ4W5N1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCA11PQ4W5N1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCA11PQ4W5N1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCA11PQ4W5N1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCA11PQ4W5N1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCA11PQ4W5N1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCA11PQ4W5N1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCA11PQ4W5N1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCA11PQ4W5N1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCA11PQ4W5N1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCA11PQ4W5N1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCA11PQ4W5N1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCA11PQ4W5N1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCA11PQ4W5N1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCA11PQ4W5N1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCA11PQ4W5N1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCA11PQ4W5N1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCA11PQ4W5N1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCA11PQ4W5N1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCA11PQ4W5N1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCA11PQ4W5N1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCA11PQ4W5N1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCA11PQ4W5N1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCA11PQ4W5N1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCA11PQ4W5N1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCA11PQ4W5N1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCA11PQ4W5N1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCA11PQ4W5N1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCA11PQ4W5N1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCA11PQ4W5N1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCA11PQ4W5N1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCA11PQ4W5N1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCA11PQ4W5N1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCA11PQ4W5N1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCA11PQ4W5N1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCA11PQ4W5N1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCA11PQ4W5N1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCA11PQ4W5N1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCA11PQ4W5N1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCA11PQ4W5N1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCA11PQ4W5N1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCA11PQ4W5N1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCA11PQ4W5N1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCA11PQ4W5N1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCA11PQ4W5N1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCA11PQ4W5N1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCA11PQ4W5N1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCA11PQ4W5N1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCA11PQ4W5N1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCA11PQ4W5N1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCA11PQ4W5N1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCA11PQ4W5N1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCA11PQ4W5N1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCA11PQ4W5N1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCA11PQ4W5N1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCA11PQ4W5N1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCA11PQ4W5N1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCA11PQ4W5N1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCA11PQ4W5N1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCA11PQ4W5N1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCA11PQ4W5N1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCA11PQ4W5N1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCA11PQ4W5N1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCA11PQ4W5N1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCA11PQ4W5N1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCA11PQ4W5N1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCA11PQ4W5N1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCA11PQ4W5N1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCA11PQ4W5N1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCA11PQ4W5N1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCA11PQ4W5N1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCA11PQ4W5N1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms