Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXF1

FAM74A3, Putative protein FAM74A3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A3Q4VXF1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM74A3Q4VXF1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM74A3Q4VXF1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM74A3Q4VXF1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM74A3Q4VXF1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM74A3Q4VXF1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM74A3Q4VXF1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM74A3Q4VXF1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM74A3Q4VXF1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM74A3Q4VXF1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM74A3Q4VXF1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM74A3Q4VXF1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM74A3Q4VXF1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM74A3Q4VXF1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM74A3Q4VXF1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM74A3Q4VXF1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM74A3Q4VXF1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM74A3Q4VXF1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM74A3Q4VXF1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM74A3Q4VXF1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM74A3Q4VXF1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM74A3Q4VXF1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM74A3Q4VXF1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM74A3Q4VXF1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM74A3Q4VXF1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM74A3Q4VXF1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM74A3Q4VXF1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM74A3Q4VXF1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM74A3Q4VXF1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM74A3Q4VXF1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM74A3Q4VXF1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM74A3Q4VXF1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM74A3Q4VXF1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM74A3Q4VXF1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM74A3Q4VXF1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM74A3Q4VXF1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM74A3Q4VXF1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM74A3Q4VXF1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM74A3Q4VXF1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM74A3Q4VXF1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM74A3Q4VXF1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM74A3Q4VXF1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM74A3Q4VXF1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM74A3Q4VXF1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM74A3Q4VXF1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FAM74A3Q4VXF1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM74A3Q4VXF1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM74A3Q4VXF1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM74A3Q4VXF1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM74A3Q4VXF1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM74A3Q4VXF1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM74A3Q4VXF1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM74A3Q4VXF1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM74A3Q4VXF1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM74A3Q4VXF1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM74A3Q4VXF1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM74A3Q4VXF1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM74A3Q4VXF1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM74A3Q4VXF1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM74A3Q4VXF1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM74A3Q4VXF1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM74A3Q4VXF1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM74A3Q4VXF1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM74A3Q4VXF1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM74A3Q4VXF1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM74A3Q4VXF1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM74A3Q4VXF1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM74A3Q4VXF1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM74A3Q4VXF1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM74A3Q4VXF1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM74A3Q4VXF1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM74A3Q4VXF1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM74A3Q4VXF1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM74A3Q4VXF1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM74A3Q4VXF1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM74A3Q4VXF1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM74A3Q4VXF1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM74A3Q4VXF1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM74A3Q4VXF1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM74A3Q4VXF1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM74A3Q4VXF1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM74A3Q4VXF1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM74A3Q4VXF1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM74A3Q4VXF1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM74A3Q4VXF1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM74A3Q4VXF1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM74A3Q4VXF1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM74A3Q4VXF1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM74A3Q4VXF1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM74A3Q4VXF1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM74A3Q4VXF1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM74A3Q4VXF1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM74A3Q4VXF1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM74A3Q4VXF1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM74A3Q4VXF1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM74A3Q4VXF1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM74A3Q4VXF1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM74A3Q4VXF1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM74A3Q4VXF1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM74A3Q4VXF1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms