Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EDRF1Q3B7T1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
EDRF1Q3B7T1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EDRF1Q3B7T1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EDRF1Q3B7T1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EDRF1Q3B7T1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EDRF1Q3B7T1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EDRF1Q3B7T1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
EDRF1Q3B7T1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EDRF1Q3B7T1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
EDRF1Q3B7T1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EDRF1Q3B7T1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EDRF1Q3B7T1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
EDRF1Q3B7T1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EDRF1Q3B7T1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EDRF1Q3B7T1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EDRF1Q3B7T1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
EDRF1Q3B7T1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EDRF1Q3B7T1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EDRF1Q3B7T1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EDRF1Q3B7T1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EDRF1Q3B7T1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EDRF1Q3B7T1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EDRF1Q3B7T1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EDRF1Q3B7T1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EDRF1Q3B7T1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EDRF1Q3B7T1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EDRF1Q3B7T1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EDRF1Q3B7T1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EDRF1Q3B7T1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EDRF1Q3B7T1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EDRF1Q3B7T1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EDRF1Q3B7T1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EDRF1Q3B7T1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EDRF1Q3B7T1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EDRF1Q3B7T1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EDRF1Q3B7T1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EDRF1Q3B7T1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EDRF1Q3B7T1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EDRF1Q3B7T1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EDRF1Q3B7T1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EDRF1Q3B7T1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EDRF1Q3B7T1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EDRF1Q3B7T1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EDRF1Q3B7T1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EDRF1Q3B7T1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EDRF1Q3B7T1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EDRF1Q3B7T1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EDRF1Q3B7T1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EDRF1Q3B7T1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EDRF1Q3B7T1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EDRF1Q3B7T1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EDRF1Q3B7T1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EDRF1Q3B7T1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EDRF1Q3B7T1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EDRF1Q3B7T1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
EDRF1Q3B7T1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EDRF1Q3B7T1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EDRF1Q3B7T1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EDRF1Q3B7T1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EDRF1Q3B7T1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EDRF1Q3B7T1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EDRF1Q3B7T1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EDRF1Q3B7T1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EDRF1Q3B7T1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EDRF1Q3B7T1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EDRF1Q3B7T1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EDRF1Q3B7T1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EDRF1Q3B7T1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EDRF1Q3B7T1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EDRF1Q3B7T1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
EDRF1Q3B7T1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EDRF1Q3B7T1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EDRF1Q3B7T1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EDRF1Q3B7T1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EDRF1Q3B7T1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
EDRF1Q3B7T1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EDRF1Q3B7T1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EDRF1Q3B7T1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EDRF1Q3B7T1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EDRF1Q3B7T1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EDRF1Q3B7T1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EDRF1Q3B7T1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EDRF1Q3B7T1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EDRF1Q3B7T1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
EDRF1Q3B7T1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
EDRF1Q3B7T1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EDRF1Q3B7T1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EDRF1Q3B7T1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
EDRF1Q3B7T1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EDRF1Q3B7T1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
EDRF1Q3B7T1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EDRF1Q3B7T1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EDRF1Q3B7T1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EDRF1Q3B7T1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EDRF1Q3B7T1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EDRF1Q3B7T1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EDRF1Q3B7T1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EDRF1Q3B7T1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EDRF1Q3B7T1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms