Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAY7

SMU1, WD40 repeat-containing protein SMU1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMU1Q2TAY7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMU1Q2TAY7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMU1Q2TAY7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMU1Q2TAY7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMU1Q2TAY7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMU1Q2TAY7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMU1Q2TAY7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMU1Q2TAY7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMU1Q2TAY7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMU1Q2TAY7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMU1Q2TAY7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMU1Q2TAY7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMU1Q2TAY7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMU1Q2TAY7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMU1Q2TAY7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMU1Q2TAY7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SMU1Q2TAY7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMU1Q2TAY7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMU1Q2TAY7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMU1Q2TAY7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMU1Q2TAY7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMU1Q2TAY7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMU1Q2TAY7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMU1Q2TAY7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMU1Q2TAY7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMU1Q2TAY7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMU1Q2TAY7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMU1Q2TAY7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMU1Q2TAY7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMU1Q2TAY7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMU1Q2TAY7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMU1Q2TAY7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMU1Q2TAY7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMU1Q2TAY7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SMU1Q2TAY7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMU1Q2TAY7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMU1Q2TAY7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMU1Q2TAY7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMU1Q2TAY7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMU1Q2TAY7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMU1Q2TAY7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMU1Q2TAY7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMU1Q2TAY7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMU1Q2TAY7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SMU1Q2TAY7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMU1Q2TAY7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMU1Q2TAY7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMU1Q2TAY7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMU1Q2TAY7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMU1Q2TAY7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMU1Q2TAY7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMU1Q2TAY7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMU1Q2TAY7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMU1Q2TAY7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMU1Q2TAY7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMU1Q2TAY7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMU1Q2TAY7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMU1Q2TAY7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMU1Q2TAY7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMU1Q2TAY7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMU1Q2TAY7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMU1Q2TAY7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMU1Q2TAY7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMU1Q2TAY7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMU1Q2TAY7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMU1Q2TAY7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMU1Q2TAY7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMU1Q2TAY7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMU1Q2TAY7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMU1Q2TAY7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMU1Q2TAY7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMU1Q2TAY7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMU1Q2TAY7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMU1Q2TAY7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMU1Q2TAY7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMU1Q2TAY7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMU1Q2TAY7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMU1Q2TAY7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMU1Q2TAY7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMU1Q2TAY7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMU1Q2TAY7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMU1Q2TAY7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMU1Q2TAY7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMU1Q2TAY7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMU1Q2TAY7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SMU1Q2TAY7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMU1Q2TAY7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMU1Q2TAY7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMU1Q2TAY7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMU1Q2TAY7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMU1Q2TAY7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMU1Q2TAY7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMU1Q2TAY7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SMU1Q2TAY7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMU1Q2TAY7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMU1Q2TAY7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMU1Q2TAY7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMU1Q2TAY7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMU1Q2TAY7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMU1Q2TAY7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms