Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q1T7F1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q1T7F1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q1T7F1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q1T7F1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q1T7F1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q1T7F1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q1T7F1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q1T7F1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q1T7F1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q1T7F1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q1T7F1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q1T7F1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q1T7F1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Q1T7F1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q1T7F1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q1T7F1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q1T7F1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q1T7F1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q1T7F1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q1T7F1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q1T7F1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q1T7F1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q1T7F1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q1T7F1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q1T7F1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q1T7F1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q1T7F1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q1T7F1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q1T7F1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q1T7F1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q1T7F1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q1T7F1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q1T7F1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q1T7F1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q1T7F1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q1T7F1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q1T7F1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q1T7F1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q1T7F1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q1T7F1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q1T7F1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q1T7F1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q1T7F1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q1T7F1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q1T7F1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q1T7F1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q1T7F1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q1T7F1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q1T7F1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q1T7F1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q1T7F1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q1T7F1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q1T7F1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q1T7F1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q1T7F1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q1T7F1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q1T7F1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q1T7F1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q1T7F1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q1T7F1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q1T7F1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q1T7F1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q1T7F1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q1T7F1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q1T7F1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q1T7F1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q1T7F1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q1T7F1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q1T7F1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q1T7F1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q1T7F1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q1T7F1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q1T7F1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q1T7F1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q1T7F1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q1T7F1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q1T7F1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q1T7F1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q1T7F1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q1T7F1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q1T7F1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q1T7F1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q1T7F1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q1T7F1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q1T7F1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q1T7F1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q1T7F1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q1T7F1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q1T7F1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q1T7F1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q1T7F1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q1T7F1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q1T7F1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q1T7F1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q1T7F1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q1T7F1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q1T7F1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q1T7F1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q1T7F1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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