Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IMPG1Q17R60 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IMPG1Q17R60 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IMPG1Q17R60 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IMPG1Q17R60 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IMPG1Q17R60 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IMPG1Q17R60 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IMPG1Q17R60 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IMPG1Q17R60 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IMPG1Q17R60 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
IMPG1Q17R60 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IMPG1Q17R60 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IMPG1Q17R60 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IMPG1Q17R60 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IMPG1Q17R60 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IMPG1Q17R60 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IMPG1Q17R60 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
IMPG1Q17R60 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
IMPG1Q17R60 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IMPG1Q17R60 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IMPG1Q17R60 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IMPG1Q17R60 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IMPG1Q17R60 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IMPG1Q17R60 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IMPG1Q17R60 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IMPG1Q17R60 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IMPG1Q17R60 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IMPG1Q17R60 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IMPG1Q17R60 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IMPG1Q17R60 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IMPG1Q17R60 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IMPG1Q17R60 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IMPG1Q17R60 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
IMPG1Q17R60 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IMPG1Q17R60 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
IMPG1Q17R60 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IMPG1Q17R60 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IMPG1Q17R60 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IMPG1Q17R60 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IMPG1Q17R60 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IMPG1Q17R60 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IMPG1Q17R60 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IMPG1Q17R60 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IMPG1Q17R60 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IMPG1Q17R60 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IMPG1Q17R60 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IMPG1Q17R60 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IMPG1Q17R60 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IMPG1Q17R60 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IMPG1Q17R60 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IMPG1Q17R60 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IMPG1Q17R60 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IMPG1Q17R60 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IMPG1Q17R60 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IMPG1Q17R60 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IMPG1Q17R60 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IMPG1Q17R60 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IMPG1Q17R60 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IMPG1Q17R60 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IMPG1Q17R60 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IMPG1Q17R60 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IMPG1Q17R60 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IMPG1Q17R60 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IMPG1Q17R60 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IMPG1Q17R60 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IMPG1Q17R60 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IMPG1Q17R60 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IMPG1Q17R60 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IMPG1Q17R60 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IMPG1Q17R60 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IMPG1Q17R60 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IMPG1Q17R60 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IMPG1Q17R60 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IMPG1Q17R60 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IMPG1Q17R60 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IMPG1Q17R60 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IMPG1Q17R60 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IMPG1Q17R60 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
IMPG1Q17R60 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IMPG1Q17R60 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IMPG1Q17R60 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IMPG1Q17R60 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IMPG1Q17R60 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IMPG1Q17R60 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IMPG1Q17R60 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IMPG1Q17R60 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IMPG1Q17R60 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IMPG1Q17R60 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IMPG1Q17R60 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IMPG1Q17R60 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IMPG1Q17R60 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IMPG1Q17R60 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IMPG1Q17R60 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IMPG1Q17R60 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IMPG1Q17R60 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IMPG1Q17R60 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IMPG1Q17R60 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IMPG1Q17R60 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IMPG1Q17R60 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IMPG1Q17R60 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
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