Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDUFA9Q16795 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NDUFA9Q16795 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDUFA9Q16795 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDUFA9Q16795 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDUFA9Q16795 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDUFA9Q16795 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDUFA9Q16795 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDUFA9Q16795 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDUFA9Q16795 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NDUFA9Q16795 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDUFA9Q16795 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDUFA9Q16795 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDUFA9Q16795 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDUFA9Q16795 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDUFA9Q16795 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDUFA9Q16795 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDUFA9Q16795 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDUFA9Q16795 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDUFA9Q16795 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDUFA9Q16795 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NDUFA9Q16795 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NDUFA9Q16795 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDUFA9Q16795 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDUFA9Q16795 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDUFA9Q16795 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDUFA9Q16795 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDUFA9Q16795 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDUFA9Q16795 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDUFA9Q16795 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDUFA9Q16795 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDUFA9Q16795 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDUFA9Q16795 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDUFA9Q16795 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDUFA9Q16795 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDUFA9Q16795 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NDUFA9Q16795 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDUFA9Q16795 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDUFA9Q16795 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDUFA9Q16795 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
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