Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF239Q16600 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF239Q16600 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF239Q16600 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF239Q16600 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF239Q16600 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF239Q16600 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF239Q16600 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF239Q16600 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF239Q16600 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF239Q16600 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF239Q16600 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF239Q16600 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF239Q16600 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF239Q16600 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF239Q16600 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF239Q16600 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF239Q16600 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF239Q16600 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF239Q16600 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF239Q16600 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF239Q16600 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF239Q16600 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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