Protein–RNA interactions for Protein: Q16557

PSG3, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG3Q16557 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSG3Q16557 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSG3Q16557 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSG3Q16557 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSG3Q16557 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSG3Q16557 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSG3Q16557 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSG3Q16557 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSG3Q16557 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSG3Q16557 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSG3Q16557 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSG3Q16557 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSG3Q16557 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSG3Q16557 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSG3Q16557 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSG3Q16557 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSG3Q16557 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSG3Q16557 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSG3Q16557 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSG3Q16557 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSG3Q16557 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSG3Q16557 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSG3Q16557 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSG3Q16557 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSG3Q16557 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSG3Q16557 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSG3Q16557 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSG3Q16557 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSG3Q16557 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSG3Q16557 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSG3Q16557 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSG3Q16557 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSG3Q16557 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSG3Q16557 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSG3Q16557 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSG3Q16557 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSG3Q16557 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSG3Q16557 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSG3Q16557 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSG3Q16557 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSG3Q16557 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSG3Q16557 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSG3Q16557 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSG3Q16557 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSG3Q16557 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSG3Q16557 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSG3Q16557 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSG3Q16557 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSG3Q16557 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSG3Q16557 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSG3Q16557 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSG3Q16557 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSG3Q16557 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSG3Q16557 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSG3Q16557 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSG3Q16557 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSG3Q16557 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSG3Q16557 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSG3Q16557 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG3Q16557 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG3Q16557 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG3Q16557 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PSG3Q16557 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSG3Q16557 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSG3Q16557 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSG3Q16557 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSG3Q16557 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSG3Q16557 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSG3Q16557 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG3Q16557 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG3Q16557 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG3Q16557 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG3Q16557 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG3Q16557 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PSG3Q16557 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSG3Q16557 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSG3Q16557 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSG3Q16557 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSG3Q16557 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSG3Q16557 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSG3Q16557 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSG3Q16557 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PSG3Q16557 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSG3Q16557 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSG3Q16557 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSG3Q16557 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSG3Q16557 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSG3Q16557 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSG3Q16557 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSG3Q16557 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSG3Q16557 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSG3Q16557 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSG3Q16557 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSG3Q16557 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSG3Q16557 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSG3Q16557 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSG3Q16557 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSG3Q16557 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSG3Q16557 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSG3Q16557 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms