Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SNCBQ16143 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SNCBQ16143 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNCBQ16143 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNCBQ16143 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNCBQ16143 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNCBQ16143 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNCBQ16143 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNCBQ16143 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNCBQ16143 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNCBQ16143 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNCBQ16143 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNCBQ16143 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNCBQ16143 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNCBQ16143 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNCBQ16143 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNCBQ16143 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNCBQ16143 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNCBQ16143 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNCBQ16143 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNCBQ16143 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNCBQ16143 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SNCBQ16143 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SNCBQ16143 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNCBQ16143 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNCBQ16143 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNCBQ16143 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNCBQ16143 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNCBQ16143 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNCBQ16143 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNCBQ16143 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNCBQ16143 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNCBQ16143 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNCBQ16143 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNCBQ16143 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNCBQ16143 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNCBQ16143 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNCBQ16143 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNCBQ16143 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNCBQ16143 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNCBQ16143 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNCBQ16143 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SNCBQ16143 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNCBQ16143 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNCBQ16143 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNCBQ16143 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNCBQ16143 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNCBQ16143 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNCBQ16143 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNCBQ16143 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNCBQ16143 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNCBQ16143 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNCBQ16143 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNCBQ16143 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNCBQ16143 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNCBQ16143 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SNCBQ16143 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNCBQ16143 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNCBQ16143 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNCBQ16143 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNCBQ16143 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNCBQ16143 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNCBQ16143 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNCBQ16143 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNCBQ16143 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNCBQ16143 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNCBQ16143 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNCBQ16143 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNCBQ16143 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNCBQ16143 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNCBQ16143 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNCBQ16143 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNCBQ16143 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNCBQ16143 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNCBQ16143 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNCBQ16143 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNCBQ16143 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNCBQ16143 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNCBQ16143 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SNCBQ16143 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SNCBQ16143 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNCBQ16143 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNCBQ16143 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNCBQ16143 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNCBQ16143 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SNCBQ16143 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNCBQ16143 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNCBQ16143 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNCBQ16143 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNCBQ16143 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNCBQ16143 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNCBQ16143 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNCBQ16143 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNCBQ16143 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNCBQ16143 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNCBQ16143 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNCBQ16143 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNCBQ16143 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNCBQ16143 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNCBQ16143 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
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