Protein–RNA interactions for Protein: Q15513

SPHAR, Protein SPHAR, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHARQ15513 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPHARQ15513 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPHARQ15513 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPHARQ15513 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPHARQ15513 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPHARQ15513 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPHARQ15513 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPHARQ15513 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPHARQ15513 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPHARQ15513 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPHARQ15513 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPHARQ15513 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPHARQ15513 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPHARQ15513 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPHARQ15513 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPHARQ15513 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPHARQ15513 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPHARQ15513 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPHARQ15513 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPHARQ15513 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPHARQ15513 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPHARQ15513 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPHARQ15513 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPHARQ15513 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPHARQ15513 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPHARQ15513 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPHARQ15513 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPHARQ15513 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPHARQ15513 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPHARQ15513 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPHARQ15513 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPHARQ15513 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SPHARQ15513 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPHARQ15513 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPHARQ15513 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPHARQ15513 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPHARQ15513 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPHARQ15513 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPHARQ15513 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPHARQ15513 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPHARQ15513 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPHARQ15513 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPHARQ15513 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPHARQ15513 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPHARQ15513 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPHARQ15513 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPHARQ15513 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHARQ15513 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHARQ15513 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHARQ15513 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHARQ15513 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHARQ15513 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPHARQ15513 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPHARQ15513 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPHARQ15513 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPHARQ15513 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHARQ15513 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPHARQ15513 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPHARQ15513 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPHARQ15513 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPHARQ15513 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPHARQ15513 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPHARQ15513 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPHARQ15513 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPHARQ15513 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHARQ15513 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHARQ15513 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPHARQ15513 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHARQ15513 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHARQ15513 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHARQ15513 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHARQ15513 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHARQ15513 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHARQ15513 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHARQ15513 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHARQ15513 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHARQ15513 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPHARQ15513 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SPHARQ15513 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SPHARQ15513 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPHARQ15513 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPHARQ15513 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPHARQ15513 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPHARQ15513 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHARQ15513 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPHARQ15513 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHARQ15513 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHARQ15513 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHARQ15513 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPHARQ15513 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPHARQ15513 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPHARQ15513 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPHARQ15513 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPHARQ15513 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPHARQ15513 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPHARQ15513 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPHARQ15513 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPHARQ15513 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPHARQ15513 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPHARQ15513 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms