Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

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Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RYR3Q15413 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RYR3Q15413 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RYR3Q15413 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RYR3Q15413 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RYR3Q15413 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RYR3Q15413 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RYR3Q15413 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RYR3Q15413 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RYR3Q15413 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYR3Q15413 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYR3Q15413 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYR3Q15413 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYR3Q15413 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYR3Q15413 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RYR3Q15413 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RYR3Q15413 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RYR3Q15413 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RYR3Q15413 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RYR3Q15413 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RYR3Q15413 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RYR3Q15413 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RYR3Q15413 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RYR3Q15413 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RYR3Q15413 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RYR3Q15413 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RYR3Q15413 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RYR3Q15413 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RYR3Q15413 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RYR3Q15413 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RYR3Q15413 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RYR3Q15413 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RYR3Q15413 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RYR3Q15413 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RYR3Q15413 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RYR3Q15413 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RYR3Q15413 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RYR3Q15413 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RYR3Q15413 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RYR3Q15413 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RYR3Q15413 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RYR3Q15413 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RYR3Q15413 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RYR3Q15413 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RYR3Q15413 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RYR3Q15413 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RYR3Q15413 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RYR3Q15413 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RYR3Q15413 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RYR3Q15413 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RYR3Q15413 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RYR3Q15413 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RYR3Q15413 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RYR3Q15413 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RYR3Q15413 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RYR3Q15413 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
RYR3Q15413 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RYR3Q15413 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RYR3Q15413 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RYR3Q15413 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RYR3Q15413 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RYR3Q15413 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RYR3Q15413 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RYR3Q15413 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RYR3Q15413 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RYR3Q15413 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RYR3Q15413 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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