Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB35Q15286 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB35Q15286 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB35Q15286 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB35Q15286 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB35Q15286 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB35Q15286 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB35Q15286 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB35Q15286 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB35Q15286 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB35Q15286 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB35Q15286 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB35Q15286 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB35Q15286 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB35Q15286 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB35Q15286 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB35Q15286 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB35Q15286 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB35Q15286 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB35Q15286 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB35Q15286 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB35Q15286 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB35Q15286 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB35Q15286 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB35Q15286 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB35Q15286 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB35Q15286 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB35Q15286 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB35Q15286 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB35Q15286 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB35Q15286 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB35Q15286 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB35Q15286 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB35Q15286 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB35Q15286 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB35Q15286 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB35Q15286 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB35Q15286 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB35Q15286 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB35Q15286 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB35Q15286 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB35Q15286 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB35Q15286 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB35Q15286 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB35Q15286 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB35Q15286 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB35Q15286 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB35Q15286 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB35Q15286 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB35Q15286 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB35Q15286 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB35Q15286 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB35Q15286 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB35Q15286 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB35Q15286 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB35Q15286 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB35Q15286 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB35Q15286 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB35Q15286 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB35Q15286 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB35Q15286 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB35Q15286 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB35Q15286 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB35Q15286 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB35Q15286 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB35Q15286 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB35Q15286 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB35Q15286 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB35Q15286 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB35Q15286 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB35Q15286 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB35Q15286 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB35Q15286 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB35Q15286 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB35Q15286 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB35Q15286 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB35Q15286 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB35Q15286 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB35Q15286 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB35Q15286 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB35Q15286 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB35Q15286 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB35Q15286 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB35Q15286 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB35Q15286 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB35Q15286 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB35Q15286 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB35Q15286 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB35Q15286 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB35Q15286 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB35Q15286 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB35Q15286 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB35Q15286 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB35Q15286 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB35Q15286 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB35Q15286 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB35Q15286 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB35Q15286 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB35Q15286 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB35Q15286 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms