Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCM1Q15154 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PCM1Q15154 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCM1Q15154 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCM1Q15154 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCM1Q15154 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCM1Q15154 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCM1Q15154 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCM1Q15154 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PCM1Q15154 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PCM1Q15154 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCM1Q15154 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCM1Q15154 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCM1Q15154 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCM1Q15154 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCM1Q15154 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCM1Q15154 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PCM1Q15154 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCM1Q15154 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCM1Q15154 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCM1Q15154 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCM1Q15154 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCM1Q15154 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCM1Q15154 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCM1Q15154 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCM1Q15154 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PCM1Q15154 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCM1Q15154 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCM1Q15154 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCM1Q15154 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCM1Q15154 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCM1Q15154 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCM1Q15154 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCM1Q15154 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCM1Q15154 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCM1Q15154 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCM1Q15154 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCM1Q15154 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PCM1Q15154 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCM1Q15154 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCM1Q15154 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCM1Q15154 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCM1Q15154 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCM1Q15154 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCM1Q15154 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCM1Q15154 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PCM1Q15154 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCM1Q15154 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCM1Q15154 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCM1Q15154 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCM1Q15154 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCM1Q15154 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCM1Q15154 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PCM1Q15154 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCM1Q15154 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCM1Q15154 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCM1Q15154 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCM1Q15154 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCM1Q15154 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCM1Q15154 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCM1Q15154 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PCM1Q15154 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCM1Q15154 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCM1Q15154 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCM1Q15154 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCM1Q15154 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCM1Q15154 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCM1Q15154 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCM1Q15154 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCM1Q15154 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PCM1Q15154 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCM1Q15154 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCM1Q15154 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCM1Q15154 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PCM1Q15154 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
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PCM1Q15154 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCM1Q15154 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCM1Q15154 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCM1Q15154 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCM1Q15154 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PCM1Q15154 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PCM1Q15154 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCM1Q15154 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCM1Q15154 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PCM1Q15154 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCM1Q15154 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCM1Q15154 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCM1Q15154 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCM1Q15154 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCM1Q15154 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCM1Q15154 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCM1Q15154 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCM1Q15154 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCM1Q15154 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCM1Q15154 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCM1Q15154 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCM1Q15154 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCM1Q15154 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCM1Q15154 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
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