Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRD3Q15059 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRD3Q15059 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRD3Q15059 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRD3Q15059 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRD3Q15059 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRD3Q15059 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRD3Q15059 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRD3Q15059 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRD3Q15059 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD3Q15059 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRD3Q15059 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRD3Q15059 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRD3Q15059 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRD3Q15059 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRD3Q15059 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
BRD3Q15059 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD3Q15059 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRD3Q15059 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRD3Q15059 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRD3Q15059 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRD3Q15059 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD3Q15059 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD3Q15059 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD3Q15059 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD3Q15059 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD3Q15059 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRD3Q15059 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRD3Q15059 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
BRD3Q15059 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRD3Q15059 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRD3Q15059 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRD3Q15059 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BRD3Q15059 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRD3Q15059 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRD3Q15059 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRD3Q15059 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD3Q15059 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD3Q15059 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD3Q15059 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD3Q15059 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD3Q15059 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRD3Q15059 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRD3Q15059 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRD3Q15059 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRD3Q15059 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRD3Q15059 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRD3Q15059 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRD3Q15059 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRD3Q15059 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRD3Q15059 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRD3Q15059 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRD3Q15059 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRD3Q15059 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRD3Q15059 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRD3Q15059 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BRD3Q15059 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRD3Q15059 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BRD3Q15059 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD3Q15059 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD3Q15059 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD3Q15059 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD3Q15059 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRD3Q15059 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRD3Q15059 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRD3Q15059 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRD3Q15059 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD3Q15059 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD3Q15059 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD3Q15059 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD3Q15059 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD3Q15059 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD3Q15059 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD3Q15059 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD3Q15059 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD3Q15059 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD3Q15059 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD3Q15059 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD3Q15059 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRD3Q15059 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRD3Q15059 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRD3Q15059 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRD3Q15059 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRD3Q15059 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRD3Q15059 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRD3Q15059 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
BRD3Q15059 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRD3Q15059 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRD3Q15059 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRD3Q15059 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRD3Q15059 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRD3Q15059 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRD3Q15059 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRD3Q15059 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRD3Q15059 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRD3Q15059 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRD3Q15059 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms