Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMCO1Q147U7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMCO1Q147U7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMCO1Q147U7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMCO1Q147U7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMCO1Q147U7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMCO1Q147U7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMCO1Q147U7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMCO1Q147U7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMCO1Q147U7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMCO1Q147U7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMCO1Q147U7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMCO1Q147U7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMCO1Q147U7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMCO1Q147U7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMCO1Q147U7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMCO1Q147U7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMCO1Q147U7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMCO1Q147U7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMCO1Q147U7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMCO1Q147U7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMCO1Q147U7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMCO1Q147U7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMCO1Q147U7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMCO1Q147U7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMCO1Q147U7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMCO1Q147U7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMCO1Q147U7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMCO1Q147U7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMCO1Q147U7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMCO1Q147U7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMCO1Q147U7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMCO1Q147U7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMCO1Q147U7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMCO1Q147U7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMCO1Q147U7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMCO1Q147U7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMCO1Q147U7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMCO1Q147U7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMCO1Q147U7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMCO1Q147U7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMCO1Q147U7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMCO1Q147U7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMCO1Q147U7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMCO1Q147U7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMCO1Q147U7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMCO1Q147U7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMCO1Q147U7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMCO1Q147U7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMCO1Q147U7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMCO1Q147U7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMCO1Q147U7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMCO1Q147U7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMCO1Q147U7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMCO1Q147U7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMCO1Q147U7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMCO1Q147U7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMCO1Q147U7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMCO1Q147U7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMCO1Q147U7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMCO1Q147U7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMCO1Q147U7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMCO1Q147U7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMCO1Q147U7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMCO1Q147U7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMCO1Q147U7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMCO1Q147U7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMCO1Q147U7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMCO1Q147U7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMCO1Q147U7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMCO1Q147U7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMCO1Q147U7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMCO1Q147U7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMCO1Q147U7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMCO1Q147U7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMCO1Q147U7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMCO1Q147U7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMCO1Q147U7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMCO1Q147U7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMCO1Q147U7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMCO1Q147U7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMCO1Q147U7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMCO1Q147U7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMCO1Q147U7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMCO1Q147U7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMCO1Q147U7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMCO1Q147U7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMCO1Q147U7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMCO1Q147U7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMCO1Q147U7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMCO1Q147U7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMCO1Q147U7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMCO1Q147U7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMCO1Q147U7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMCO1Q147U7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMCO1Q147U7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMCO1Q147U7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMCO1Q147U7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMCO1Q147U7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMCO1Q147U7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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