Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CBX2Q14781 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CBX2Q14781 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CBX2Q14781 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CBX2Q14781 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CBX2Q14781 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CBX2Q14781 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CBX2Q14781 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CBX2Q14781 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CBX2Q14781 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CBX2Q14781 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CBX2Q14781 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CBX2Q14781 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CBX2Q14781 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CBX2Q14781 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CBX2Q14781 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CBX2Q14781 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CBX2Q14781 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CBX2Q14781 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CBX2Q14781 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CBX2Q14781 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CBX2Q14781 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CBX2Q14781 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CBX2Q14781 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CBX2Q14781 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CBX2Q14781 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CBX2Q14781 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CBX2Q14781 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CBX2Q14781 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CBX2Q14781 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CBX2Q14781 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CBX2Q14781 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CBX2Q14781 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CBX2Q14781 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CBX2Q14781 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CBX2Q14781 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CBX2Q14781 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CBX2Q14781 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CBX2Q14781 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CBX2Q14781 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CBX2Q14781 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CBX2Q14781 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CBX2Q14781 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CBX2Q14781 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CBX2Q14781 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CBX2Q14781 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CBX2Q14781 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CBX2Q14781 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CBX2Q14781 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CBX2Q14781 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CBX2Q14781 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CBX2Q14781 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CBX2Q14781 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CBX2Q14781 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CBX2Q14781 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CBX2Q14781 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CBX2Q14781 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CBX2Q14781 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CBX2Q14781 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CBX2Q14781 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CBX2Q14781 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CBX2Q14781 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CBX2Q14781 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CBX2Q14781 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CBX2Q14781 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CBX2Q14781 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CBX2Q14781 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CBX2Q14781 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CBX2Q14781 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CBX2Q14781 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CBX2Q14781 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CBX2Q14781 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CBX2Q14781 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CBX2Q14781 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CBX2Q14781 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CBX2Q14781 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CBX2Q14781 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CBX2Q14781 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CBX2Q14781 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CBX2Q14781 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CBX2Q14781 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CBX2Q14781 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CBX2Q14781 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CBX2Q14781 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CBX2Q14781 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CBX2Q14781 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CBX2Q14781 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CBX2Q14781 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CBX2Q14781 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CBX2Q14781 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CBX2Q14781 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CBX2Q14781 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CBX2Q14781 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CBX2Q14781 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CBX2Q14781 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CBX2Q14781 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CBX2Q14781 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CBX2Q14781 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CBX2Q14781 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CBX2Q14781 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
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