Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GBX1Q14549 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GBX1Q14549 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GBX1Q14549 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GBX1Q14549 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GBX1Q14549 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GBX1Q14549 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GBX1Q14549 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GBX1Q14549 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GBX1Q14549 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GBX1Q14549 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GBX1Q14549 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GBX1Q14549 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GBX1Q14549 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GBX1Q14549 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBX1Q14549 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBX1Q14549 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBX1Q14549 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBX1Q14549 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBX1Q14549 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBX1Q14549 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBX1Q14549 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBX1Q14549 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBX1Q14549 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBX1Q14549 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GBX1Q14549 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBX1Q14549 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GBX1Q14549 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GBX1Q14549 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GBX1Q14549 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GBX1Q14549 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GBX1Q14549 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GBX1Q14549 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GBX1Q14549 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GBX1Q14549 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GBX1Q14549 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GBX1Q14549 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GBX1Q14549 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GBX1Q14549 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GBX1Q14549 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GBX1Q14549 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GBX1Q14549 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GBX1Q14549 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GBX1Q14549 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GBX1Q14549 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GBX1Q14549 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GBX1Q14549 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GBX1Q14549 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GBX1Q14549 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GBX1Q14549 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GBX1Q14549 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GBX1Q14549 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
GBX1Q14549 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GBX1Q14549 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GBX1Q14549 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GBX1Q14549 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GBX1Q14549 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GBX1Q14549 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GBX1Q14549 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GBX1Q14549 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GBX1Q14549 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GBX1Q14549 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GBX1Q14549 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GBX1Q14549 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GBX1Q14549 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GBX1Q14549 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
GBX1Q14549 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GBX1Q14549 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GBX1Q14549 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GBX1Q14549 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GBX1Q14549 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GBX1Q14549 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GBX1Q14549 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GBX1Q14549 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GBX1Q14549 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GBX1Q14549 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GBX1Q14549 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GBX1Q14549 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GBX1Q14549 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GBX1Q14549 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GBX1Q14549 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GBX1Q14549 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBX1Q14549 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBX1Q14549 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBX1Q14549 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBX1Q14549 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GBX1Q14549 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GBX1Q14549 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBX1Q14549 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBX1Q14549 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBX1Q14549 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GBX1Q14549 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBX1Q14549 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBX1Q14549 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GBX1Q14549 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GBX1Q14549 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GBX1Q14549 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GBX1Q14549 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GBX1Q14549 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GBX1Q14549 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
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