Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TNFAIP1Q13829 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
TNFAIP1Q13829 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
TNFAIP1Q13829 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNFAIP1Q13829 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNFAIP1Q13829 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNFAIP1Q13829 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNFAIP1Q13829 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNFAIP1Q13829 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNFAIP1Q13829 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNFAIP1Q13829 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNFAIP1Q13829 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNFAIP1Q13829 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNFAIP1Q13829 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNFAIP1Q13829 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNFAIP1Q13829 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNFAIP1Q13829 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNFAIP1Q13829 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNFAIP1Q13829 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNFAIP1Q13829 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNFAIP1Q13829 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNFAIP1Q13829 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TNFAIP1Q13829 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
TNFAIP1Q13829 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
TNFAIP1Q13829 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
TNFAIP1Q13829 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
TNFAIP1Q13829 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
TNFAIP1Q13829 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
TNFAIP1Q13829 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNFAIP1Q13829 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNFAIP1Q13829 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNFAIP1Q13829 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TNFAIP1Q13829 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
TNFAIP1Q13829 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TNFAIP1Q13829 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TNFAIP1Q13829 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
TNFAIP1Q13829 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TNFAIP1Q13829 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TNFAIP1Q13829 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
TNFAIP1Q13829 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TNFAIP1Q13829 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TNFAIP1Q13829 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TNFAIP1Q13829 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TNFAIP1Q13829 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TNFAIP1Q13829 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TNFAIP1Q13829 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TNFAIP1Q13829 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TNFAIP1Q13829 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TNFAIP1Q13829 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TNFAIP1Q13829 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TNFAIP1Q13829 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TNFAIP1Q13829 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TNFAIP1Q13829 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TNFAIP1Q13829 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TNFAIP1Q13829 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TNFAIP1Q13829 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TNFAIP1Q13829 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TNFAIP1Q13829 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TNFAIP1Q13829 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNFAIP1Q13829 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
TNFAIP1Q13829 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNFAIP1Q13829 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNFAIP1Q13829 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNFAIP1Q13829 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNFAIP1Q13829 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNFAIP1Q13829 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNFAIP1Q13829 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNFAIP1Q13829 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNFAIP1Q13829 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNFAIP1Q13829 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNFAIP1Q13829 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNFAIP1Q13829 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TNFAIP1Q13829 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TNFAIP1Q13829 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNFAIP1Q13829 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNFAIP1Q13829 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNFAIP1Q13829 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNFAIP1Q13829 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNFAIP1Q13829 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNFAIP1Q13829 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNFAIP1Q13829 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNFAIP1Q13829 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
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