Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GOLGA4Q13439 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GOLGA4Q13439 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GOLGA4Q13439 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA4Q13439 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA4Q13439 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA4Q13439 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA4Q13439 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA4Q13439 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOLGA4Q13439 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA4Q13439 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA4Q13439 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA4Q13439 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA4Q13439 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA4Q13439 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOLGA4Q13439 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GOLGA4Q13439 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA4Q13439 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA4Q13439 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA4Q13439 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA4Q13439 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA4Q13439 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA4Q13439 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA4Q13439 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA4Q13439 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA4Q13439 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA4Q13439 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA4Q13439 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA4Q13439 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA4Q13439 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms