Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL49Q13405 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL49Q13405 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL49Q13405 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL49Q13405 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL49Q13405 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL49Q13405 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL49Q13405 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MRPL49Q13405 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL49Q13405 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL49Q13405 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL49Q13405 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL49Q13405 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL49Q13405 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL49Q13405 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL49Q13405 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL49Q13405 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL49Q13405 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL49Q13405 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL49Q13405 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL49Q13405 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL49Q13405 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL49Q13405 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL49Q13405 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL49Q13405 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL49Q13405 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL49Q13405 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL49Q13405 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL49Q13405 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL49Q13405 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL49Q13405 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL49Q13405 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL49Q13405 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL49Q13405 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL49Q13405 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL49Q13405 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL49Q13405 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL49Q13405 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL49Q13405 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL49Q13405 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL49Q13405 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL49Q13405 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL49Q13405 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL49Q13405 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MRPL49Q13405 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL49Q13405 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL49Q13405 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL49Q13405 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL49Q13405 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL49Q13405 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL49Q13405 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL49Q13405 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL49Q13405 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL49Q13405 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL49Q13405 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL49Q13405 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL49Q13405 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL49Q13405 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL49Q13405 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL49Q13405 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL49Q13405 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL49Q13405 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL49Q13405 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL49Q13405 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL49Q13405 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL49Q13405 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL49Q13405 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL49Q13405 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL49Q13405 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL49Q13405 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL49Q13405 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL49Q13405 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL49Q13405 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL49Q13405 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL49Q13405 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL49Q13405 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL49Q13405 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL49Q13405 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL49Q13405 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL49Q13405 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL49Q13405 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL49Q13405 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL49Q13405 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL49Q13405 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL49Q13405 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL49Q13405 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL49Q13405 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL49Q13405 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL49Q13405 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL49Q13405 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL49Q13405 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL49Q13405 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL49Q13405 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL49Q13405 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL49Q13405 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL49Q13405 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL49Q13405 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL49Q13405 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL49Q13405 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL49Q13405 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
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