Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRSQ13332 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRSQ13332 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRSQ13332 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRSQ13332 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRSQ13332 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRSQ13332 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRSQ13332 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRSQ13332 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRSQ13332 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRSQ13332 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRSQ13332 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRSQ13332 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRSQ13332 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRSQ13332 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRSQ13332 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRSQ13332 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRSQ13332 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRSQ13332 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRSQ13332 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRSQ13332 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRSQ13332 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRSQ13332 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRSQ13332 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRSQ13332 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRSQ13332 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRSQ13332 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRSQ13332 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRSQ13332 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRSQ13332 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRSQ13332 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRSQ13332 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRSQ13332 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRSQ13332 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRSQ13332 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRSQ13332 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRSQ13332 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRSQ13332 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRSQ13332 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRSQ13332 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRSQ13332 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRSQ13332 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PTPRSQ13332 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRSQ13332 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRSQ13332 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRSQ13332 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRSQ13332 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRSQ13332 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRSQ13332 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRSQ13332 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRSQ13332 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRSQ13332 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRSQ13332 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRSQ13332 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRSQ13332 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRSQ13332 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRSQ13332 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRSQ13332 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRSQ13332 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRSQ13332 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRSQ13332 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRSQ13332 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRSQ13332 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
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PTPRSQ13332 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRSQ13332 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRSQ13332 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRSQ13332 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRSQ13332 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRSQ13332 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
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PTPRSQ13332 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
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PTPRSQ13332 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
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PTPRSQ13332 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRSQ13332 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRSQ13332 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRSQ13332 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRSQ13332 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRSQ13332 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRSQ13332 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRSQ13332 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRSQ13332 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRSQ13332 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRSQ13332 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRSQ13332 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRSQ13332 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRSQ13332 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRSQ13332 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRSQ13332 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRSQ13332 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRSQ13332 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRSQ13332 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRSQ13332 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRSQ13332 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
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