Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERCC8Q13216 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERCC8Q13216 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERCC8Q13216 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERCC8Q13216 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERCC8Q13216 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERCC8Q13216 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERCC8Q13216 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERCC8Q13216 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERCC8Q13216 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERCC8Q13216 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERCC8Q13216 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERCC8Q13216 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERCC8Q13216 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERCC8Q13216 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERCC8Q13216 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERCC8Q13216 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERCC8Q13216 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERCC8Q13216 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERCC8Q13216 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERCC8Q13216 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ERCC8Q13216 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERCC8Q13216 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERCC8Q13216 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERCC8Q13216 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERCC8Q13216 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERCC8Q13216 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERCC8Q13216 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERCC8Q13216 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERCC8Q13216 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERCC8Q13216 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERCC8Q13216 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ERCC8Q13216 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERCC8Q13216 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERCC8Q13216 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERCC8Q13216 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERCC8Q13216 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERCC8Q13216 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERCC8Q13216 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERCC8Q13216 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERCC8Q13216 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERCC8Q13216 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERCC8Q13216 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERCC8Q13216 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERCC8Q13216 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERCC8Q13216 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERCC8Q13216 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERCC8Q13216 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERCC8Q13216 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERCC8Q13216 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERCC8Q13216 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERCC8Q13216 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERCC8Q13216 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERCC8Q13216 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERCC8Q13216 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERCC8Q13216 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ERCC8Q13216 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERCC8Q13216 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERCC8Q13216 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERCC8Q13216 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERCC8Q13216 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERCC8Q13216 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERCC8Q13216 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERCC8Q13216 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERCC8Q13216 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERCC8Q13216 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERCC8Q13216 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERCC8Q13216 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERCC8Q13216 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERCC8Q13216 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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ERCC8Q13216 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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ERCC8Q13216 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERCC8Q13216 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERCC8Q13216 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERCC8Q13216 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERCC8Q13216 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERCC8Q13216 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERCC8Q13216 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERCC8Q13216 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERCC8Q13216 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERCC8Q13216 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERCC8Q13216 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERCC8Q13216 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ERCC8Q13216 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERCC8Q13216 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERCC8Q13216 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERCC8Q13216 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERCC8Q13216 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERCC8Q13216 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERCC8Q13216 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERCC8Q13216 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERCC8Q13216 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ERCC8Q13216 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ERCC8Q13216 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ERCC8Q13216 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ERCC8Q13216 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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