Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TRAF1Q13077 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TRAF1Q13077 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TRAF1Q13077 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TRAF1Q13077 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TRAF1Q13077 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TRAF1Q13077 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TRAF1Q13077 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TRAF1Q13077 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TRAF1Q13077 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TRAF1Q13077 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TRAF1Q13077 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TRAF1Q13077 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TRAF1Q13077 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TRAF1Q13077 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TRAF1Q13077 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TRAF1Q13077 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TRAF1Q13077 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TRAF1Q13077 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TRAF1Q13077 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TRAF1Q13077 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TRAF1Q13077 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TRAF1Q13077 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.49
TRAF1Q13077 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRAF1Q13077 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRAF1Q13077 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TRAF1Q13077 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TRAF1Q13077 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TRAF1Q13077 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
TRAF1Q13077 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TRAF1Q13077 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
TRAF1Q13077 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRAF1Q13077 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRAF1Q13077 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRAF1Q13077 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRAF1Q13077 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRAF1Q13077 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRAF1Q13077 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRAF1Q13077 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAF1Q13077 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAF1Q13077 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAF1Q13077 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAF1Q13077 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAF1Q13077 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAF1Q13077 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRAF1Q13077 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRAF1Q13077 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRAF1Q13077 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRAF1Q13077 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRAF1Q13077 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.48
TRAF1Q13077 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRAF1Q13077 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRAF1Q13077 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAF1Q13077 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAF1Q13077 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAF1Q13077 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAF1Q13077 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAF1Q13077 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAF1Q13077 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAF1Q13077 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRAF1Q13077 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRAF1Q13077 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRAF1Q13077 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TRAF1Q13077 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TRAF1Q13077 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRAF1Q13077 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRAF1Q13077 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRAF1Q13077 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRAF1Q13077 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRAF1Q13077 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRAF1Q13077 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRAF1Q13077 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRAF1Q13077 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRAF1Q13077 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRAF1Q13077 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRAF1Q13077 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
TRAF1Q13077 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
TRAF1Q13077 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRAF1Q13077 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
TRAF1Q13077 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRAF1Q13077 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TRAF1Q13077 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TRAF1Q13077 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRAF1Q13077 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRAF1Q13077 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRAF1Q13077 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRAF1Q13077 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRAF1Q13077 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRAF1Q13077 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRAF1Q13077 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRAF1Q13077 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRAF1Q13077 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TRAF1Q13077 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAF1Q13077 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAF1Q13077 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAF1Q13077 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRAF1Q13077 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRAF1Q13077 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRAF1Q13077 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRAF1Q13077 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
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