Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC16Q13042 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC16Q13042 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC16Q13042 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC16Q13042 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC16Q13042 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC16Q13042 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC16Q13042 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDC16Q13042 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC16Q13042 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC16Q13042 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC16Q13042 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC16Q13042 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDC16Q13042 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDC16Q13042 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC16Q13042 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC16Q13042 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC16Q13042 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC16Q13042 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC16Q13042 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC16Q13042 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC16Q13042 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC16Q13042 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC16Q13042 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC16Q13042 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms