Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSTF3Q12996 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSTF3Q12996 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSTF3Q12996 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSTF3Q12996 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSTF3Q12996 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSTF3Q12996 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSTF3Q12996 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSTF3Q12996 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSTF3Q12996 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSTF3Q12996 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSTF3Q12996 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSTF3Q12996 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSTF3Q12996 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSTF3Q12996 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSTF3Q12996 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSTF3Q12996 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CSTF3Q12996 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CSTF3Q12996 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSTF3Q12996 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSTF3Q12996 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSTF3Q12996 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSTF3Q12996 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSTF3Q12996 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSTF3Q12996 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSTF3Q12996 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CSTF3Q12996 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSTF3Q12996 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSTF3Q12996 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSTF3Q12996 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSTF3Q12996 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSTF3Q12996 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSTF3Q12996 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSTF3Q12996 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSTF3Q12996 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSTF3Q12996 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSTF3Q12996 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSTF3Q12996 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSTF3Q12996 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSTF3Q12996 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSTF3Q12996 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSTF3Q12996 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSTF3Q12996 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSTF3Q12996 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSTF3Q12996 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSTF3Q12996 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSTF3Q12996 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSTF3Q12996 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSTF3Q12996 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CSTF3Q12996 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CSTF3Q12996 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSTF3Q12996 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSTF3Q12996 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSTF3Q12996 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSTF3Q12996 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSTF3Q12996 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSTF3Q12996 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSTF3Q12996 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSTF3Q12996 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSTF3Q12996 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSTF3Q12996 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSTF3Q12996 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSTF3Q12996 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSTF3Q12996 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSTF3Q12996 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSTF3Q12996 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSTF3Q12996 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSTF3Q12996 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSTF3Q12996 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSTF3Q12996 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSTF3Q12996 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSTF3Q12996 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSTF3Q12996 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSTF3Q12996 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSTF3Q12996 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSTF3Q12996 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSTF3Q12996 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSTF3Q12996 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSTF3Q12996 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSTF3Q12996 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CSTF3Q12996 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSTF3Q12996 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSTF3Q12996 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CSTF3Q12996 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSTF3Q12996 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSTF3Q12996 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSTF3Q12996 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSTF3Q12996 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSTF3Q12996 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSTF3Q12996 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSTF3Q12996 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSTF3Q12996 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CSTF3Q12996 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSTF3Q12996 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSTF3Q12996 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSTF3Q12996 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSTF3Q12996 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSTF3Q12996 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSTF3Q12996 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CSTF3Q12996 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
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