Protein–RNA interactions for Protein: Q11206

ST3GAL4, CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2,3-sialyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST3GAL4Q11206 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ST3GAL4Q11206 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ST3GAL4Q11206 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ST3GAL4Q11206 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ST3GAL4Q11206 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ST3GAL4Q11206 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ST3GAL4Q11206 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ST3GAL4Q11206 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ST3GAL4Q11206 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ST3GAL4Q11206 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ST3GAL4Q11206 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ST3GAL4Q11206 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ST3GAL4Q11206 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ST3GAL4Q11206 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ST3GAL4Q11206 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ST3GAL4Q11206 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ST3GAL4Q11206 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ST3GAL4Q11206 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ST3GAL4Q11206 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ST3GAL4Q11206 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ST3GAL4Q11206 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ST3GAL4Q11206 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ST3GAL4Q11206 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ST3GAL4Q11206 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ST3GAL4Q11206 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ST3GAL4Q11206 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ST3GAL4Q11206 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ST3GAL4Q11206 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ST3GAL4Q11206 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ST3GAL4Q11206 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ST3GAL4Q11206 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ST3GAL4Q11206 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ST3GAL4Q11206 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ST3GAL4Q11206 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ST3GAL4Q11206 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ST3GAL4Q11206 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ST3GAL4Q11206 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ST3GAL4Q11206 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ST3GAL4Q11206 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ST3GAL4Q11206 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ST3GAL4Q11206 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ST3GAL4Q11206 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ST3GAL4Q11206 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ST3GAL4Q11206 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ST3GAL4Q11206 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ST3GAL4Q11206 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ST3GAL4Q11206 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ST3GAL4Q11206 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ST3GAL4Q11206 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ST3GAL4Q11206 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ST3GAL4Q11206 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ST3GAL4Q11206 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ST3GAL4Q11206 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ST3GAL4Q11206 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ST3GAL4Q11206 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ST3GAL4Q11206 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ST3GAL4Q11206 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ST3GAL4Q11206 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ST3GAL4Q11206 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ST3GAL4Q11206 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ST3GAL4Q11206 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ST3GAL4Q11206 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ST3GAL4Q11206 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ST3GAL4Q11206 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ST3GAL4Q11206 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ST3GAL4Q11206 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ST3GAL4Q11206 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ST3GAL4Q11206 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ST3GAL4Q11206 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ST3GAL4Q11206 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ST3GAL4Q11206 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ST3GAL4Q11206 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ST3GAL4Q11206 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ST3GAL4Q11206 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ST3GAL4Q11206 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ST3GAL4Q11206 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ST3GAL4Q11206 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ST3GAL4Q11206 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ST3GAL4Q11206 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ST3GAL4Q11206 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ST3GAL4Q11206 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ST3GAL4Q11206 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ST3GAL4Q11206 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ST3GAL4Q11206 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ST3GAL4Q11206 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ST3GAL4Q11206 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ST3GAL4Q11206 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ST3GAL4Q11206 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ST3GAL4Q11206 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ST3GAL4Q11206 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ST3GAL4Q11206 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ST3GAL4Q11206 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ST3GAL4Q11206 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ST3GAL4Q11206 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ST3GAL4Q11206 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ST3GAL4Q11206 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ST3GAL4Q11206 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ST3GAL4Q11206 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ST3GAL4Q11206 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ST3GAL4Q11206 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
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