Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCNQ0VAF6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCNQ0VAF6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCNQ0VAF6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCNQ0VAF6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCNQ0VAF6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCNQ0VAF6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCNQ0VAF6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SYCNQ0VAF6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCNQ0VAF6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCNQ0VAF6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SYCNQ0VAF6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCNQ0VAF6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCNQ0VAF6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYCNQ0VAF6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCNQ0VAF6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCNQ0VAF6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYCNQ0VAF6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYCNQ0VAF6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYCNQ0VAF6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCNQ0VAF6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCNQ0VAF6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCNQ0VAF6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCNQ0VAF6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCNQ0VAF6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCNQ0VAF6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCNQ0VAF6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCNQ0VAF6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCNQ0VAF6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCNQ0VAF6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCNQ0VAF6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCNQ0VAF6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCNQ0VAF6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCNQ0VAF6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCNQ0VAF6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCNQ0VAF6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCNQ0VAF6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCNQ0VAF6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCNQ0VAF6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCNQ0VAF6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCNQ0VAF6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCNQ0VAF6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCNQ0VAF6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCNQ0VAF6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYCNQ0VAF6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYCNQ0VAF6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYCNQ0VAF6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYCNQ0VAF6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYCNQ0VAF6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYCNQ0VAF6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYCNQ0VAF6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYCNQ0VAF6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYCNQ0VAF6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYCNQ0VAF6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCNQ0VAF6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCNQ0VAF6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCNQ0VAF6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCNQ0VAF6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYCNQ0VAF6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYCNQ0VAF6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYCNQ0VAF6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCNQ0VAF6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCNQ0VAF6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCNQ0VAF6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCNQ0VAF6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCNQ0VAF6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCNQ0VAF6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms