Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPPLY1Q0D2K3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPPLY1Q0D2K3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPPLY1Q0D2K3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPPLY1Q0D2K3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPPLY1Q0D2K3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPPLY1Q0D2K3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPPLY1Q0D2K3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPPLY1Q0D2K3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPPLY1Q0D2K3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPPLY1Q0D2K3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIPPLY1Q0D2K3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIPPLY1Q0D2K3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIPPLY1Q0D2K3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIPPLY1Q0D2K3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIPPLY1Q0D2K3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIPPLY1Q0D2K3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIPPLY1Q0D2K3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIPPLY1Q0D2K3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIPPLY1Q0D2K3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPPLY1Q0D2K3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIPPLY1Q0D2K3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPPLY1Q0D2K3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPPLY1Q0D2K3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPPLY1Q0D2K3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPPLY1Q0D2K3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPPLY1Q0D2K3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPPLY1Q0D2K3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPPLY1Q0D2K3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPPLY1Q0D2K3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPPLY1Q0D2K3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPPLY1Q0D2K3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RIPPLY1Q0D2K3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPPLY1Q0D2K3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPPLY1Q0D2K3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPPLY1Q0D2K3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPPLY1Q0D2K3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPPLY1Q0D2K3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIPPLY1Q0D2K3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIPPLY1Q0D2K3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPPLY1Q0D2K3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPPLY1Q0D2K3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPPLY1Q0D2K3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPPLY1Q0D2K3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPPLY1Q0D2K3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPPLY1Q0D2K3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPPLY1Q0D2K3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPPLY1Q0D2K3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIPPLY1Q0D2K3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIPPLY1Q0D2K3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIPPLY1Q0D2K3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIPPLY1Q0D2K3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIPPLY1Q0D2K3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RIPPLY1Q0D2K3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPPLY1Q0D2K3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPPLY1Q0D2K3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPPLY1Q0D2K3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIPPLY1Q0D2K3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIPPLY1Q0D2K3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPPLY1Q0D2K3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPPLY1Q0D2K3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIPPLY1Q0D2K3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RIPPLY1Q0D2K3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPPLY1Q0D2K3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPPLY1Q0D2K3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPPLY1Q0D2K3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPPLY1Q0D2K3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPPLY1Q0D2K3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPPLY1Q0D2K3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPPLY1Q0D2K3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPPLY1Q0D2K3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPPLY1Q0D2K3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPPLY1Q0D2K3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPPLY1Q0D2K3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPPLY1Q0D2K3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPPLY1Q0D2K3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPPLY1Q0D2K3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPPLY1Q0D2K3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPPLY1Q0D2K3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPPLY1Q0D2K3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPPLY1Q0D2K3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIPPLY1Q0D2K3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPPLY1Q0D2K3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPPLY1Q0D2K3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPPLY1Q0D2K3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPPLY1Q0D2K3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms