Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC43.96■■■■■ 4.63
GOLGA3Q08378 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
GOLGA3Q08378 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
GOLGA3Q08378 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
GOLGA3Q08378 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
GOLGA3Q08378 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.63
GOLGA3Q08378 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
GOLGA3Q08378 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
GOLGA3Q08378 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
GOLGA3Q08378 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
GOLGA3Q08378 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
GOLGA3Q08378 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC43.88■■■■■ 4.61
GOLGA3Q08378 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
GOLGA3Q08378 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC43.87■■■■■ 4.61
GOLGA3Q08378 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
GOLGA3Q08378 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC43.86■■■■■ 4.61
GOLGA3Q08378 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
GOLGA3Q08378 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
GOLGA3Q08378 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
GOLGA3Q08378 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC43.83■■■■■ 4.61
GOLGA3Q08378 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
GOLGA3Q08378 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
GOLGA3Q08378 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.82■■■■■ 4.6
GOLGA3Q08378 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
GOLGA3Q08378 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
GOLGA3Q08378 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
GOLGA3Q08378 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
GOLGA3Q08378 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC43.78■■■■■ 4.6
GOLGA3Q08378 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
GOLGA3Q08378 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
GOLGA3Q08378 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
GOLGA3Q08378 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
GOLGA3Q08378 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
GOLGA3Q08378 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
GOLGA3Q08378 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC43.71■■■■■ 4.59
GOLGA3Q08378 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
GOLGA3Q08378 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC43.7■■■■■ 4.59
GOLGA3Q08378 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC43.7■■■■■ 4.59
GOLGA3Q08378 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
GOLGA3Q08378 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
GOLGA3Q08378 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
GOLGA3Q08378 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
GOLGA3Q08378 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
GOLGA3Q08378 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC43.64■■■■■ 4.58
GOLGA3Q08378 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
GOLGA3Q08378 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
GOLGA3Q08378 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
GOLGA3Q08378 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
GOLGA3Q08378 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
GOLGA3Q08378 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC43.57■■■■■ 4.57
GOLGA3Q08378 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC43.57■■■■■ 4.57
GOLGA3Q08378 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.57
GOLGA3Q08378 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.56
GOLGA3Q08378 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.56
GOLGA3Q08378 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
GOLGA3Q08378 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
GOLGA3Q08378 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
GOLGA3Q08378 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.53■■■■■ 4.56
GOLGA3Q08378 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
GOLGA3Q08378 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
GOLGA3Q08378 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC43.51■■■■■ 4.56
GOLGA3Q08378 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
GOLGA3Q08378 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
GOLGA3Q08378 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
GOLGA3Q08378 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
GOLGA3Q08378 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
GOLGA3Q08378 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
GOLGA3Q08378 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.5■■■■■ 4.55
GOLGA3Q08378 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC43.5■■■■■ 4.55
GOLGA3Q08378 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
GOLGA3Q08378 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC43.47■■■■■ 4.55
GOLGA3Q08378 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
GOLGA3Q08378 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
GOLGA3Q08378 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC43.46■■■■■ 4.55
GOLGA3Q08378 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
GOLGA3Q08378 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.55
GOLGA3Q08378 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
GOLGA3Q08378 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC43.44■■■■■ 4.54
GOLGA3Q08378 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
GOLGA3Q08378 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
GOLGA3Q08378 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
GOLGA3Q08378 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
GOLGA3Q08378 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
GOLGA3Q08378 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC43.41■■■■■ 4.54
GOLGA3Q08378 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC43.41■■■■■ 4.54
GOLGA3Q08378 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
GOLGA3Q08378 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
GOLGA3Q08378 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
GOLGA3Q08378 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
GOLGA3Q08378 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
GOLGA3Q08378 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
GOLGA3Q08378 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
GOLGA3Q08378 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
GOLGA3Q08378 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC43.36■■■■■ 4.53
GOLGA3Q08378 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC43.35■■■■■ 4.53
GOLGA3Q08378 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
GOLGA3Q08378 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC43.34■■■■■ 4.53
GOLGA3Q08378 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
GOLGA3Q08378 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.33■■■■■ 4.53
GOLGA3Q08378 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms