Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC3A1Q07837 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC3A1Q07837 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC3A1Q07837 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC3A1Q07837 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC3A1Q07837 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC3A1Q07837 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC3A1Q07837 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC3A1Q07837 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC3A1Q07837 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC3A1Q07837 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC3A1Q07837 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC3A1Q07837 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC3A1Q07837 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC3A1Q07837 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC3A1Q07837 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC3A1Q07837 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC3A1Q07837 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC3A1Q07837 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC3A1Q07837 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC3A1Q07837 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC3A1Q07837 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC3A1Q07837 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC3A1Q07837 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC3A1Q07837 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC3A1Q07837 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC3A1Q07837 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC3A1Q07837 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC3A1Q07837 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC3A1Q07837 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC3A1Q07837 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC3A1Q07837 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC3A1Q07837 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC3A1Q07837 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC3A1Q07837 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC3A1Q07837 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC3A1Q07837 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC3A1Q07837 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC3A1Q07837 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC3A1Q07837 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC3A1Q07837 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC3A1Q07837 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC3A1Q07837 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC3A1Q07837 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC3A1Q07837 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC3A1Q07837 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC3A1Q07837 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC3A1Q07837 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC3A1Q07837 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC3A1Q07837 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC3A1Q07837 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC3A1Q07837 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC3A1Q07837 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC3A1Q07837 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC3A1Q07837 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC3A1Q07837 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC3A1Q07837 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC3A1Q07837 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC3A1Q07837 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC3A1Q07837 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC3A1Q07837 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC3A1Q07837 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC3A1Q07837 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC3A1Q07837 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC3A1Q07837 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC3A1Q07837 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC3A1Q07837 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC3A1Q07837 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC3A1Q07837 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC3A1Q07837 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC3A1Q07837 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC3A1Q07837 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC3A1Q07837 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC3A1Q07837 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC3A1Q07837 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC3A1Q07837 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC3A1Q07837 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC3A1Q07837 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC3A1Q07837 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC3A1Q07837 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC3A1Q07837 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC3A1Q07837 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC3A1Q07837 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC3A1Q07837 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC3A1Q07837 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC3A1Q07837 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC3A1Q07837 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC3A1Q07837 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC3A1Q07837 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC3A1Q07837 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC3A1Q07837 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC3A1Q07837 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC3A1Q07837 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC3A1Q07837 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC3A1Q07837 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC3A1Q07837 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC3A1Q07837 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC3A1Q07837 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC3A1Q07837 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC3A1Q07837 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms