Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PDE4BQ07343 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PDE4BQ07343 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PDE4BQ07343 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PDE4BQ07343 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PDE4BQ07343 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PDE4BQ07343 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PDE4BQ07343 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
PDE4BQ07343 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PDE4BQ07343 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PDE4BQ07343 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PDE4BQ07343 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
PDE4BQ07343 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PDE4BQ07343 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
PDE4BQ07343 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PDE4BQ07343 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PDE4BQ07343 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PDE4BQ07343 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PDE4BQ07343 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PDE4BQ07343 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PDE4BQ07343 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PDE4BQ07343 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PDE4BQ07343 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PDE4BQ07343 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PDE4BQ07343 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PDE4BQ07343 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PDE4BQ07343 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PDE4BQ07343 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PDE4BQ07343 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PDE4BQ07343 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PDE4BQ07343 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PDE4BQ07343 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PDE4BQ07343 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PDE4BQ07343 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PDE4BQ07343 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PDE4BQ07343 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PDE4BQ07343 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PDE4BQ07343 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PDE4BQ07343 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PDE4BQ07343 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PDE4BQ07343 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PDE4BQ07343 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PDE4BQ07343 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PDE4BQ07343 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PDE4BQ07343 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PDE4BQ07343 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PDE4BQ07343 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PDE4BQ07343 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PDE4BQ07343 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PDE4BQ07343 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PDE4BQ07343 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PDE4BQ07343 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PDE4BQ07343 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PDE4BQ07343 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PDE4BQ07343 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PDE4BQ07343 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PDE4BQ07343 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PDE4BQ07343 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PDE4BQ07343 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PDE4BQ07343 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PDE4BQ07343 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PDE4BQ07343 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PDE4BQ07343 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PDE4BQ07343 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PDE4BQ07343 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PDE4BQ07343 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PDE4BQ07343 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PDE4BQ07343 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PDE4BQ07343 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PDE4BQ07343 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PDE4BQ07343 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PDE4BQ07343 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PDE4BQ07343 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PDE4BQ07343 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PDE4BQ07343 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
PDE4BQ07343 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PDE4BQ07343 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PDE4BQ07343 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PDE4BQ07343 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PDE4BQ07343 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PDE4BQ07343 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PDE4BQ07343 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PDE4BQ07343 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PDE4BQ07343 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PDE4BQ07343 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PDE4BQ07343 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PDE4BQ07343 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PDE4BQ07343 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PDE4BQ07343 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
PDE4BQ07343 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PDE4BQ07343 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PDE4BQ07343 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PDE4BQ07343 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PDE4BQ07343 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PDE4BQ07343 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PDE4BQ07343 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PDE4BQ07343 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PDE4BQ07343 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PDE4BQ07343 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PDE4BQ07343 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms