Protein–RNA interactions for Protein: Q06481

APLP2, Amyloid-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP2Q06481 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
APLP2Q06481 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
APLP2Q06481 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
APLP2Q06481 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC41.86■■■■■ 4.29
APLP2Q06481 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
APLP2Q06481 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
APLP2Q06481 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
APLP2Q06481 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
APLP2Q06481 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
APLP2Q06481 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
APLP2Q06481 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
APLP2Q06481 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC41.81■■■■■ 4.28
APLP2Q06481 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC41.8■■■■■ 4.28
APLP2Q06481 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
APLP2Q06481 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
APLP2Q06481 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
APLP2Q06481 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
APLP2Q06481 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
APLP2Q06481 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
APLP2Q06481 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
APLP2Q06481 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
APLP2Q06481 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
APLP2Q06481 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
APLP2Q06481 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
APLP2Q06481 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
APLP2Q06481 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
APLP2Q06481 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
APLP2Q06481 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
APLP2Q06481 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
APLP2Q06481 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
APLP2Q06481 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
APLP2Q06481 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
APLP2Q06481 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
APLP2Q06481 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
APLP2Q06481 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
APLP2Q06481 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
APLP2Q06481 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
APLP2Q06481 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
APLP2Q06481 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
APLP2Q06481 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC41.67■■■■■ 4.26
APLP2Q06481 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC41.66■■■■■ 4.26
APLP2Q06481 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
APLP2Q06481 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
APLP2Q06481 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
APLP2Q06481 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
APLP2Q06481 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC41.63■■■■■ 4.25
APLP2Q06481 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
APLP2Q06481 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
APLP2Q06481 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
APLP2Q06481 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
APLP2Q06481 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
APLP2Q06481 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
APLP2Q06481 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
APLP2Q06481 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
APLP2Q06481 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
APLP2Q06481 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
APLP2Q06481 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
APLP2Q06481 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
APLP2Q06481 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC41.55■■■■■ 4.24
APLP2Q06481 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC41.54■■■■■ 4.24
APLP2Q06481 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
APLP2Q06481 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
APLP2Q06481 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
APLP2Q06481 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
APLP2Q06481 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
APLP2Q06481 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
APLP2Q06481 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
APLP2Q06481 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
APLP2Q06481 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
APLP2Q06481 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
APLP2Q06481 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
APLP2Q06481 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.45■■■■■ 4.23
APLP2Q06481 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.23
APLP2Q06481 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
APLP2Q06481 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
APLP2Q06481 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
APLP2Q06481 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
APLP2Q06481 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
APLP2Q06481 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
APLP2Q06481 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
APLP2Q06481 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
APLP2Q06481 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
APLP2Q06481 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
APLP2Q06481 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
APLP2Q06481 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
APLP2Q06481 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
APLP2Q06481 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
APLP2Q06481 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC41.38■■■■■ 4.21
APLP2Q06481 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
APLP2Q06481 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
APLP2Q06481 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC41.36■■■■■ 4.21
APLP2Q06481 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
APLP2Q06481 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
APLP2Q06481 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
APLP2Q06481 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC41.32■■■■■ 4.21
APLP2Q06481 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.31■■■■■ 4.2
APLP2Q06481 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
APLP2Q06481 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
APLP2Q06481 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
APLP2Q06481 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms