Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD164Q04900 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD164Q04900 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD164Q04900 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD164Q04900 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD164Q04900 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD164Q04900 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD164Q04900 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD164Q04900 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD164Q04900 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD164Q04900 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD164Q04900 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD164Q04900 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD164Q04900 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD164Q04900 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD164Q04900 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD164Q04900 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD164Q04900 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD164Q04900 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD164Q04900 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD164Q04900 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD164Q04900 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD164Q04900 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD164Q04900 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD164Q04900 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD164Q04900 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD164Q04900 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD164Q04900 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD164Q04900 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD164Q04900 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD164Q04900 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD164Q04900 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD164Q04900 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD164Q04900 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD164Q04900 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD164Q04900 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD164Q04900 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD164Q04900 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD164Q04900 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD164Q04900 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD164Q04900 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD164Q04900 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD164Q04900 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD164Q04900 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD164Q04900 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD164Q04900 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD164Q04900 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD164Q04900 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD164Q04900 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD164Q04900 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD164Q04900 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD164Q04900 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD164Q04900 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD164Q04900 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD164Q04900 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD164Q04900 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD164Q04900 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD164Q04900 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD164Q04900 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD164Q04900 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD164Q04900 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD164Q04900 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD164Q04900 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD164Q04900 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD164Q04900 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD164Q04900 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD164Q04900 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD164Q04900 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD164Q04900 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD164Q04900 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD164Q04900 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD164Q04900 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD164Q04900 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD164Q04900 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD164Q04900 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD164Q04900 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD164Q04900 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD164Q04900 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD164Q04900 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD164Q04900 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD164Q04900 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD164Q04900 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD164Q04900 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD164Q04900 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD164Q04900 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD164Q04900 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD164Q04900 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD164Q04900 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD164Q04900 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD164Q04900 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD164Q04900 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD164Q04900 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD164Q04900 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD164Q04900 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD164Q04900 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD164Q04900 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD164Q04900 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD164Q04900 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD164Q04900 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD164Q04900 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms