Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRB3Q04118 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRB3Q04118 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRB3Q04118 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRB3Q04118 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRB3Q04118 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRB3Q04118 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRB3Q04118 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRB3Q04118 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRB3Q04118 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRB3Q04118 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRB3Q04118 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRB3Q04118 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRB3Q04118 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRB3Q04118 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRB3Q04118 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRB3Q04118 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRB3Q04118 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRB3Q04118 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRB3Q04118 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRB3Q04118 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRB3Q04118 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRB3Q04118 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRB3Q04118 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRB3Q04118 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRB3Q04118 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRB3Q04118 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRB3Q04118 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRB3Q04118 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRB3Q04118 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRB3Q04118 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRB3Q04118 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRB3Q04118 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRB3Q04118 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRB3Q04118 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRB3Q04118 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRB3Q04118 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRB3Q04118 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRB3Q04118 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRB3Q04118 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRB3Q04118 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRB3Q04118 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRB3Q04118 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRB3Q04118 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRB3Q04118 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRB3Q04118 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRB3Q04118 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRB3Q04118 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRB3Q04118 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRB3Q04118 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRB3Q04118 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRB3Q04118 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRB3Q04118 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRB3Q04118 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRB3Q04118 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRB3Q04118 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRB3Q04118 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRB3Q04118 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRB3Q04118 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRB3Q04118 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRB3Q04118 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRB3Q04118 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRB3Q04118 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRB3Q04118 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRB3Q04118 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRB3Q04118 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRB3Q04118 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRB3Q04118 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PRB3Q04118 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRB3Q04118 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PRB3Q04118 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRB3Q04118 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRB3Q04118 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRB3Q04118 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRB3Q04118 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRB3Q04118 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRB3Q04118 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRB3Q04118 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRB3Q04118 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRB3Q04118 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRB3Q04118 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRB3Q04118 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRB3Q04118 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRB3Q04118 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRB3Q04118 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRB3Q04118 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRB3Q04118 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PRB3Q04118 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRB3Q04118 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRB3Q04118 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRB3Q04118 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRB3Q04118 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRB3Q04118 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRB3Q04118 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRB3Q04118 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRB3Q04118 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRB3Q04118 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRB3Q04118 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRB3Q04118 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRB3Q04118 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms