Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNC4Q03721 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNC4Q03721 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNC4Q03721 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNC4Q03721 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNC4Q03721 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNC4Q03721 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNC4Q03721 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNC4Q03721 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNC4Q03721 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNC4Q03721 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNC4Q03721 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNC4Q03721 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNC4Q03721 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNC4Q03721 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNC4Q03721 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNC4Q03721 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNC4Q03721 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNC4Q03721 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNC4Q03721 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNC4Q03721 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNC4Q03721 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNC4Q03721 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNC4Q03721 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNC4Q03721 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNC4Q03721 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNC4Q03721 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNC4Q03721 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNC4Q03721 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNC4Q03721 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNC4Q03721 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNC4Q03721 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNC4Q03721 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNC4Q03721 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNC4Q03721 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNC4Q03721 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNC4Q03721 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNC4Q03721 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNC4Q03721 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNC4Q03721 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNC4Q03721 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNC4Q03721 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNC4Q03721 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNC4Q03721 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNC4Q03721 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNC4Q03721 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNC4Q03721 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNC4Q03721 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNC4Q03721 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNC4Q03721 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNC4Q03721 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNC4Q03721 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNC4Q03721 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNC4Q03721 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNC4Q03721 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNC4Q03721 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNC4Q03721 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNC4Q03721 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNC4Q03721 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNC4Q03721 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNC4Q03721 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNC4Q03721 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNC4Q03721 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNC4Q03721 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNC4Q03721 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNC4Q03721 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNC4Q03721 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNC4Q03721 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNC4Q03721 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNC4Q03721 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNC4Q03721 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNC4Q03721 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNC4Q03721 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNC4Q03721 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNC4Q03721 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNC4Q03721 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNC4Q03721 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNC4Q03721 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNC4Q03721 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNC4Q03721 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNC4Q03721 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNC4Q03721 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNC4Q03721 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNC4Q03721 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNC4Q03721 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNC4Q03721 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNC4Q03721 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNC4Q03721 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNC4Q03721 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNC4Q03721 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNC4Q03721 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNC4Q03721 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNC4Q03721 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNC4Q03721 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNC4Q03721 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNC4Q03721 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNC4Q03721 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNC4Q03721 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNC4Q03721 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNC4Q03721 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms