Protein–RNA interactions for Protein: Q02948

VPS30, Vacuolar protein sorting-associated protein 30, yeastyeast

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS30Q02948 VRG4YGL225W 1014 nt10.62□□□□□ -0.71
VPS30Q02948 BRR1YPR057W 1026 nt10.62□□□□□ -0.71
VPS30Q02948 RIM8YGL045W 1629 nt10.62□□□□□ -0.71
VPS30Q02948 MEP3YPR138C 1470 nt10.61□□□□□ -0.71
VPS30Q02948 SPT20YOL148C 1815 nt10.61□□□□□ -0.71
VPS30Q02948 CPD1YGR247W 720 nt10.61□□□□□ -0.71
VPS30Q02948 YMR103CYMR103C 363 nt10.6□□□□□ -0.71
VPS30Q02948 YJL055WYJL055W 738 nt10.59□□□□□ -0.71
VPS30Q02948 TOA2YKL058W 369 nt10.58□□□□□ -0.72
VPS30Q02948 CSM1YCR086W 573 nt10.56□□□□□ -0.72
VPS30Q02948 FRE6YLL051C 2139 nt10.56□□□□□ -0.72
VPS30Q02948 SFP1YLR403W 2052 nt10.55□□□□□ -0.72
VPS30Q02948 MAE1YKL029C 2010 nt10.54□□□□□ -0.72
VPS30Q02948 SHY1YGR112W 1170 nt10.53□□□□□ -0.72
VPS30Q02948 GND2YGR256W 1479 nt10.52□□□□□ -0.73
VPS30Q02948 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.51□□□□□ -0.73
VPS30Q02948 SSN3YPL042C 1668 nt10.5□□□□□ -0.73
VPS30Q02948 UFO1YML088W 2007 nt10.5□□□□□ -0.73
VPS30Q02948 ESS1YJR017C 513 nt10.5□□□□□ -0.73
VPS30Q02948 YGL114WYGL114W 2178 nt10.49□□□□□ -0.73
VPS30Q02948 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt10.48□□□□□ -0.73
VPS30Q02948 LSB5YCL034W 1065 nt10.48□□□□□ -0.73
VPS30Q02948 YJL118WYJL118W 660 nt10.46□□□□□ -0.73
VPS30Q02948 PHO23YNL097C 993 nt10.46□□□□□ -0.73
VPS30Q02948 BNI5YNL166C 1347 nt10.46□□□□□ -0.73
VPS30Q02948 CCT5YJR064W 1689 nt10.46□□□□□ -0.74
VPS30Q02948 SAM3YPL274W 1764 nt10.44□□□□□ -0.74
VPS30Q02948 NUC1YJL208C 990 nt10.44□□□□□ -0.74
VPS30Q02948 URA6YKL024C 615 nt10.43□□□□□ -0.74
VPS30Q02948 GAL3YDR009W 1563 nt10.43□□□□□ -0.74
VPS30Q02948 RPT5YOR117W 1305 nt10.42□□□□□ -0.74
VPS30Q02948 ZRT3YKL175W 1512 nt10.42□□□□□ -0.74
VPS30Q02948 MSC1YML128C 1542 nt10.42□□□□□ -0.74
VPS30Q02948 OYE3YPL171C 1203 nt10.41□□□□□ -0.74
VPS30Q02948 SAM2YDR502C 1155 nt10.4□□□□□ -0.74
VPS30Q02948 SEC61YLR378C 1443 nt10.4□□□□□ -0.75
VPS30Q02948 INA1YLR413W 2028 nt10.38□□□□□ -0.75
VPS30Q02948 OXA1YER154W 1209 nt10.38□□□□□ -0.75
VPS30Q02948 NPP1YCR026C 2229 nt10.38□□□□□ -0.75
VPS30Q02948 RIB7YBR153W 735 nt10.37□□□□□ -0.75
VPS30Q02948 RPC82YPR190C 1965 nt10.37□□□□□ -0.75
VPS30Q02948 PET8YNL003C 855 nt10.35□□□□□ -0.75
VPS30Q02948 PGC1YPL206C 966 nt10.35□□□□□ -0.75
VPS30Q02948 PAU5YFL020C 369 nt10.34□□□□□ -0.75
VPS30Q02948 THI72YOR192C 1800 nt10.34□□□□□ -0.75
VPS30Q02948 FUB1YCR076C 753 nt10.33□□□□□ -0.76
VPS30Q02948 MUP1YGR055W 1725 nt10.33□□□□□ -0.76
VPS30Q02948 YER188WYER188W 720 nt10.32□□□□□ -0.76
VPS30Q02948 TPS1YBR126C 1488 nt10.31□□□□□ -0.76
VPS30Q02948 SEN2YLR105C 1134 nt10.31□□□□□ -0.76
VPS30Q02948 SNZ1YMR096W 894 nt10.31□□□□□ -0.76
VPS30Q02948 RAS2YNL098C 969 nt10.31□□□□□ -0.76
VPS30Q02948 ACO2YJL200C 2370 nt10.31□□□□□ -0.76
VPS30Q02948 YBR232CYBR232C 360 nt10.3□□□□□ -0.76
VPS30Q02948 TPO4YOR273C 1980 nt10.3□□□□□ -0.76
VPS30Q02948 FLR1YBR008C 1647 nt10.29□□□□□ -0.76
VPS30Q02948 OYE2YHR179W 1203 nt10.29□□□□□ -0.76
VPS30Q02948 YJL067WYJL067W 351 nt10.29□□□□□ -0.76
VPS30Q02948 TAF13YML098W 504 nt10.29□□□□□ -0.76
VPS30Q02948 DLD2YDL178W 1593 nt10.28□□□□□ -0.76
VPS30Q02948 STP3YLR375W 1032 nt10.28□□□□□ -0.76
VPS30Q02948 HMG2YLR450W 3138 nt10.26□□□□□ -0.77
VPS30Q02948 EAF3YPR023C 1206 nt10.26□□□□□ -0.77
VPS30Q02948 NAP1YKR048C 1254 nt10.25□□□□□ -0.77
VPS30Q02948 YPR126CYPR126C 309 nt10.24□□□□□ -0.77
VPS30Q02948 RSC8YFR037C 1674 nt10.24□□□□□ -0.77
VPS30Q02948 YPS3YLR121C 1527 nt10.23□□□□□ -0.77
VPS30Q02948 FMS1YMR020W 1527 nt10.23□□□□□ -0.77
VPS30Q02948 GID7YCL039W 2238 nt10.22□□□□□ -0.77
VPS30Q02948 DAK2YFL053W 1776 nt10.22□□□□□ -0.77
VPS30Q02948 YMR262WYMR262W 942 nt10.22□□□□□ -0.77
VPS30Q02948 PUP1YOR157C 786 nt10.21□□□□□ -0.77
VPS30Q02948 OSH7YHR001W 1314 nt10.2□□□□□ -0.78
VPS30Q02948 MHF1YOL086W-A 273 nt10.2□□□□□ -0.78
VPS30Q02948 CTI6YPL181W 1521 nt10.19□□□□□ -0.78
VPS30Q02948 SPP2YOR148C 558 nt10.18□□□□□ -0.78
VPS30Q02948 YGR139WYGR139W 339 nt10.17□□□□□ -0.78
VPS30Q02948 POT1YIL160C 1254 nt10.17□□□□□ -0.78
VPS30Q02948 YJL064WYJL064W 396 nt10.17□□□□□ -0.78
VPS30Q02948 TMA23YMR269W 636 nt10.17□□□□□ -0.78
VPS30Q02948 HEM13YDR044W 987 nt10.16□□□□□ -0.78
VPS30Q02948 CWC15YDR163W 528 nt10.16□□□□□ -0.78
VPS30Q02948 DDI1YER143W 1287 nt10.16□□□□□ -0.78
VPS30Q02948 SOL2YCR073W-A 948 nt10.15□□□□□ -0.78
VPS30Q02948 IML3YBR107C 738 nt10.15□□□□□ -0.78
VPS30Q02948 GSF2YML048W 1212 nt10.14□□□□□ -0.79
VPS30Q02948 LSM5YER146W 282 nt10.12□□□□□ -0.79
VPS30Q02948 YNL024CYNL024C 741 nt10.12□□□□□ -0.79
VPS30Q02948 ACH1YBL015W 1581 nt10.12□□□□□ -0.79
VPS30Q02948 IMO32YGR031W 1029 nt10.11□□□□□ -0.79
VPS30Q02948 PAU19YMR325W 375 nt10.11□□□□□ -0.79
VPS30Q02948 HOL1YNR055C 1761 nt10.11□□□□□ -0.79
VPS30Q02948 TUB4YLR212C 1422 nt10.1□□□□□ -0.79
VPS30Q02948 PAR32YDL173W 888 nt10.1□□□□□ -0.79
VPS30Q02948 TAT2YOL020W 1779 nt10.1□□□□□ -0.79
VPS30Q02948 URA8YJR103W 1737 nt10.1□□□□□ -0.79
VPS30Q02948 APS2YJR058C 444 nt10.09□□□□□ -0.79
VPS30Q02948 YDR455CYDR455C 309 nt10.06□□□□□ -0.8
VPS30Q02948 NIF3YGL221C 867 nt10.06□□□□□ -0.8
VPS30Q02948 YMR209CYMR209C 1374 nt10.05□□□□□ -0.8
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