Protein–RNA interactions for Protein: Q02127

DHODH, Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHODHQ02127 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHODHQ02127 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHODHQ02127 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHODHQ02127 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHODHQ02127 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHODHQ02127 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHODHQ02127 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHODHQ02127 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DHODHQ02127 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHODHQ02127 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHODHQ02127 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHODHQ02127 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHODHQ02127 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHODHQ02127 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHODHQ02127 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHODHQ02127 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHODHQ02127 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DHODHQ02127 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHODHQ02127 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHODHQ02127 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHODHQ02127 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHODHQ02127 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHODHQ02127 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHODHQ02127 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHODHQ02127 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHODHQ02127 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHODHQ02127 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHODHQ02127 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHODHQ02127 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHODHQ02127 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHODHQ02127 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHODHQ02127 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHODHQ02127 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHODHQ02127 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHODHQ02127 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHODHQ02127 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHODHQ02127 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHODHQ02127 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHODHQ02127 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHODHQ02127 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DHODHQ02127 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHODHQ02127 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DHODHQ02127 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHODHQ02127 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHODHQ02127 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHODHQ02127 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHODHQ02127 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHODHQ02127 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHODHQ02127 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHODHQ02127 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHODHQ02127 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHODHQ02127 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHODHQ02127 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHODHQ02127 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHODHQ02127 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHODHQ02127 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHODHQ02127 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHODHQ02127 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHODHQ02127 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DHODHQ02127 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHODHQ02127 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHODHQ02127 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DHODHQ02127 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DHODHQ02127 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHODHQ02127 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DHODHQ02127 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHODHQ02127 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHODHQ02127 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DHODHQ02127 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHODHQ02127 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHODHQ02127 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHODHQ02127 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHODHQ02127 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DHODHQ02127 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DHODHQ02127 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHODHQ02127 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHODHQ02127 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHODHQ02127 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHODHQ02127 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHODHQ02127 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHODHQ02127 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHODHQ02127 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHODHQ02127 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHODHQ02127 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHODHQ02127 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHODHQ02127 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHODHQ02127 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHODHQ02127 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHODHQ02127 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHODHQ02127 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHODHQ02127 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHODHQ02127 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHODHQ02127 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHODHQ02127 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHODHQ02127 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHODHQ02127 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHODHQ02127 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHODHQ02127 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHODHQ02127 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHODHQ02127 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms