Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PLCB3Q01970 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PLCB3Q01970 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PLCB3Q01970 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PLCB3Q01970 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PLCB3Q01970 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PLCB3Q01970 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PLCB3Q01970 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PLCB3Q01970 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLCB3Q01970 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLCB3Q01970 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLCB3Q01970 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLCB3Q01970 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLCB3Q01970 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLCB3Q01970 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PLCB3Q01970 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLCB3Q01970 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLCB3Q01970 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLCB3Q01970 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLCB3Q01970 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLCB3Q01970 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLCB3Q01970 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLCB3Q01970 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLCB3Q01970 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PLCB3Q01970 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PLCB3Q01970 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PLCB3Q01970 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PLCB3Q01970 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLCB3Q01970 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLCB3Q01970 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLCB3Q01970 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PLCB3Q01970 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PLCB3Q01970 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLCB3Q01970 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLCB3Q01970 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLCB3Q01970 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLCB3Q01970 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLCB3Q01970 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLCB3Q01970 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PLCB3Q01970 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLCB3Q01970 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLCB3Q01970 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLCB3Q01970 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLCB3Q01970 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PLCB3Q01970 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PLCB3Q01970 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLCB3Q01970 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLCB3Q01970 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PLCB3Q01970 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLCB3Q01970 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLCB3Q01970 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLCB3Q01970 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLCB3Q01970 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PLCB3Q01970 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PLCB3Q01970 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLCB3Q01970 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLCB3Q01970 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLCB3Q01970 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLCB3Q01970 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLCB3Q01970 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLCB3Q01970 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLCB3Q01970 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLCB3Q01970 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLCB3Q01970 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLCB3Q01970 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLCB3Q01970 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLCB3Q01970 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PLCB3Q01970 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLCB3Q01970 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLCB3Q01970 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLCB3Q01970 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PLCB3Q01970 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLCB3Q01970 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLCB3Q01970 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLCB3Q01970 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLCB3Q01970 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PLCB3Q01970 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLCB3Q01970 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLCB3Q01970 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLCB3Q01970 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLCB3Q01970 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLCB3Q01970 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLCB3Q01970 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLCB3Q01970 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLCB3Q01970 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLCB3Q01970 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLCB3Q01970 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLCB3Q01970 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLCB3Q01970 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLCB3Q01970 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLCB3Q01970 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLCB3Q01970 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PLCB3Q01970 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PLCB3Q01970 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLCB3Q01970 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLCB3Q01970 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLCB3Q01970 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLCB3Q01970 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLCB3Q01970 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PLCB3Q01970 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms