Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFA6Q01524 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DEFA6Q01524 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DEFA6Q01524 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEFA6Q01524 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEFA6Q01524 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEFA6Q01524 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEFA6Q01524 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DEFA6Q01524 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEFA6Q01524 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEFA6Q01524 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEFA6Q01524 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEFA6Q01524 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DEFA6Q01524 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DEFA6Q01524 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DEFA6Q01524 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DEFA6Q01524 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DEFA6Q01524 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DEFA6Q01524 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DEFA6Q01524 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DEFA6Q01524 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DEFA6Q01524 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DEFA6Q01524 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DEFA6Q01524 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DEFA6Q01524 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DEFA6Q01524 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DEFA6Q01524 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DEFA6Q01524 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DEFA6Q01524 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DEFA6Q01524 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DEFA6Q01524 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DEFA6Q01524 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEFA6Q01524 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEFA6Q01524 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEFA6Q01524 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEFA6Q01524 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEFA6Q01524 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DEFA6Q01524 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEFA6Q01524 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEFA6Q01524 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEFA6Q01524 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEFA6Q01524 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEFA6Q01524 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEFA6Q01524 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEFA6Q01524 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEFA6Q01524 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DEFA6Q01524 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DEFA6Q01524 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DEFA6Q01524 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DEFA6Q01524 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DEFA6Q01524 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DEFA6Q01524 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DEFA6Q01524 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DEFA6Q01524 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEFA6Q01524 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEFA6Q01524 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEFA6Q01524 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEFA6Q01524 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DEFA6Q01524 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DEFA6Q01524 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DEFA6Q01524 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEFA6Q01524 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEFA6Q01524 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DEFA6Q01524 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DEFA6Q01524 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEFA6Q01524 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DEFA6Q01524 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DEFA6Q01524 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DEFA6Q01524 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DEFA6Q01524 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEFA6Q01524 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEFA6Q01524 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DEFA6Q01524 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEFA6Q01524 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEFA6Q01524 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEFA6Q01524 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEFA6Q01524 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEFA6Q01524 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEFA6Q01524 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEFA6Q01524 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DEFA6Q01524 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEFA6Q01524 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEFA6Q01524 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DEFA6Q01524 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEFA6Q01524 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DEFA6Q01524 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DEFA6Q01524 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DEFA6Q01524 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DEFA6Q01524 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DEFA6Q01524 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEFA6Q01524 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEFA6Q01524 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEFA6Q01524 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEFA6Q01524 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEFA6Q01524 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DEFA6Q01524 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEFA6Q01524 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEFA6Q01524 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEFA6Q01524 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEFA6Q01524 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms