Protein–RNA interactions for Protein: Q01459

CTBS, Di-N-acetylchitobiase, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBSQ01459 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTBSQ01459 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTBSQ01459 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTBSQ01459 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTBSQ01459 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTBSQ01459 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTBSQ01459 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTBSQ01459 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTBSQ01459 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CTBSQ01459 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTBSQ01459 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTBSQ01459 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTBSQ01459 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTBSQ01459 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTBSQ01459 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CTBSQ01459 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTBSQ01459 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTBSQ01459 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTBSQ01459 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTBSQ01459 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTBSQ01459 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTBSQ01459 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTBSQ01459 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTBSQ01459 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTBSQ01459 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTBSQ01459 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTBSQ01459 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CTBSQ01459 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTBSQ01459 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTBSQ01459 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTBSQ01459 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTBSQ01459 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTBSQ01459 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTBSQ01459 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTBSQ01459 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTBSQ01459 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTBSQ01459 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTBSQ01459 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTBSQ01459 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTBSQ01459 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTBSQ01459 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTBSQ01459 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTBSQ01459 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTBSQ01459 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTBSQ01459 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTBSQ01459 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTBSQ01459 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTBSQ01459 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTBSQ01459 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTBSQ01459 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTBSQ01459 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTBSQ01459 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTBSQ01459 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTBSQ01459 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTBSQ01459 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTBSQ01459 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTBSQ01459 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTBSQ01459 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTBSQ01459 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTBSQ01459 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTBSQ01459 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTBSQ01459 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTBSQ01459 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTBSQ01459 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTBSQ01459 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTBSQ01459 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTBSQ01459 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTBSQ01459 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTBSQ01459 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTBSQ01459 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTBSQ01459 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTBSQ01459 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CTBSQ01459 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTBSQ01459 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTBSQ01459 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTBSQ01459 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTBSQ01459 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTBSQ01459 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTBSQ01459 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTBSQ01459 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CTBSQ01459 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTBSQ01459 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTBSQ01459 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTBSQ01459 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTBSQ01459 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTBSQ01459 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTBSQ01459 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTBSQ01459 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTBSQ01459 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTBSQ01459 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTBSQ01459 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTBSQ01459 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTBSQ01459 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTBSQ01459 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTBSQ01459 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTBSQ01459 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTBSQ01459 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTBSQ01459 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTBSQ01459 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTBSQ01459 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms