Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDKL1Q00532 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDKL1Q00532 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDKL1Q00532 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDKL1Q00532 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDKL1Q00532 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDKL1Q00532 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDKL1Q00532 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDKL1Q00532 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDKL1Q00532 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDKL1Q00532 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDKL1Q00532 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CDKL1Q00532 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDKL1Q00532 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDKL1Q00532 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDKL1Q00532 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDKL1Q00532 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDKL1Q00532 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDKL1Q00532 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDKL1Q00532 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDKL1Q00532 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDKL1Q00532 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDKL1Q00532 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDKL1Q00532 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDKL1Q00532 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDKL1Q00532 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDKL1Q00532 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDKL1Q00532 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDKL1Q00532 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDKL1Q00532 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDKL1Q00532 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDKL1Q00532 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CDKL1Q00532 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDKL1Q00532 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDKL1Q00532 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CDKL1Q00532 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CDKL1Q00532 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDKL1Q00532 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDKL1Q00532 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDKL1Q00532 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDKL1Q00532 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CDKL1Q00532 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CDKL1Q00532 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDKL1Q00532 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDKL1Q00532 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDKL1Q00532 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKL1Q00532 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKL1Q00532 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKL1Q00532 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKL1Q00532 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDKL1Q00532 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDKL1Q00532 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CDKL1Q00532 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDKL1Q00532 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDKL1Q00532 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CDKL1Q00532 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKL1Q00532 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKL1Q00532 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKL1Q00532 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKL1Q00532 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDKL1Q00532 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CDKL1Q00532 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDKL1Q00532 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDKL1Q00532 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDKL1Q00532 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDKL1Q00532 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDKL1Q00532 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDKL1Q00532 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDKL1Q00532 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDKL1Q00532 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDKL1Q00532 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDKL1Q00532 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDKL1Q00532 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDKL1Q00532 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDKL1Q00532 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDKL1Q00532 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDKL1Q00532 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKL1Q00532 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKL1Q00532 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKL1Q00532 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKL1Q00532 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKL1Q00532 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKL1Q00532 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDKL1Q00532 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDKL1Q00532 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDKL1Q00532 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDKL1Q00532 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDKL1Q00532 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDKL1Q00532 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDKL1Q00532 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDKL1Q00532 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDKL1Q00532 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDKL1Q00532 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL1Q00532 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL1Q00532 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL1Q00532 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKL1Q00532 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKL1Q00532 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKL1Q00532 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKL1Q00532 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms