Protein–RNA interactions for Protein: P86397

HTD2, Hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTD2P86397 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTD2P86397 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTD2P86397 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTD2P86397 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTD2P86397 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTD2P86397 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTD2P86397 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTD2P86397 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTD2P86397 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HTD2P86397 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTD2P86397 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTD2P86397 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTD2P86397 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTD2P86397 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTD2P86397 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTD2P86397 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTD2P86397 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTD2P86397 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTD2P86397 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HTD2P86397 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTD2P86397 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HTD2P86397 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTD2P86397 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTD2P86397 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTD2P86397 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HTD2P86397 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HTD2P86397 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTD2P86397 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTD2P86397 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTD2P86397 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTD2P86397 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HTD2P86397 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTD2P86397 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTD2P86397 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTD2P86397 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTD2P86397 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTD2P86397 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTD2P86397 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTD2P86397 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTD2P86397 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTD2P86397 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTD2P86397 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTD2P86397 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTD2P86397 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HTD2P86397 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTD2P86397 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTD2P86397 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTD2P86397 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTD2P86397 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HTD2P86397 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTD2P86397 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTD2P86397 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTD2P86397 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTD2P86397 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTD2P86397 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTD2P86397 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTD2P86397 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTD2P86397 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTD2P86397 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTD2P86397 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTD2P86397 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTD2P86397 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTD2P86397 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTD2P86397 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTD2P86397 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTD2P86397 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTD2P86397 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTD2P86397 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTD2P86397 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTD2P86397 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTD2P86397 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTD2P86397 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTD2P86397 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTD2P86397 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTD2P86397 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTD2P86397 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTD2P86397 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTD2P86397 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTD2P86397 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTD2P86397 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTD2P86397 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTD2P86397 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTD2P86397 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTD2P86397 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTD2P86397 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTD2P86397 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTD2P86397 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTD2P86397 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTD2P86397 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTD2P86397 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTD2P86397 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTD2P86397 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTD2P86397 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTD2P86397 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTD2P86397 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HTD2P86397 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HTD2P86397 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HTD2P86397 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HTD2P86397 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTD2P86397 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms